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晶晶7777

新虫 (小有名气)

[求助] Canoco软件使用用问题 已有2人参与

刚刚接触CCA,具体操作步骤有很多问题,真心请教各位
1、使用Canoco软件分析环境因子和群落种群数量关系时,样点和物种中心化或者标准化的处理都有什么作用呢?对画的图有什么改变吗?
2、还有蒙特卡洛检验有什么意义吗?他的值是有范围要求吗? 我看有的地方是说,蒙特卡洛检验值P,与零和假设有关系,P值<0.05或者<0.01时,即表明,物种和环境成显著相关。不知道这个理解正确吗?那么如果做出来的图P值很大,是不是表明不能继续分析下去呢?
3、为什么RDA画出来的图,物种信息也是箭头呢,不应该是点嘛? 但是我看有的文献里面也是用点表示的,这个可以修改吗?

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diatom7890

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
gyfgood: 金币+5, APEPI+1, 很详细,很有帮助! 2013-02-17 09:23:33
晶晶7777: 金币+15, ★★★很有帮助 2013-02-22 10:46:46
xy656691: 金币+10, 很好 2013-04-01 22:54:18
第一个问题:标准化可以去除单位或者量纲对数据的影响。群落数据中,有的物种可能用质量表示,有的物种可能用个数表示,用了标准化大家都没有单位了,变成了纯粹的数值,方便不同单位表示的物种进行比较。此外同一个群落中,有的种的生物量很大,有的生物量很小,标准化后所有物种的生物量都分布在一个同一个区间,便于进一步分析。因为数据标准化后已经不是原来的数据,所以画的图肯定会有改变。
第二个问题:该问题解释起来比较复杂。但是你的理解还是不对的,详细的解释可以参考《基于 CANOCO 的生态学数据的多元统计分析》这本书的“约束排序与置换检验”这个章节。这本书的电子版很容易找到。这章的PDF见:
http://image.sciencenet.cn/olddata/kexue.com.cn/upload/blog/file/2009/9/200991213111140966.pdf
第三个问题:这些图标只是表示方法而已,你可以完全按照自己的喜爱,改成自己想要的图标。在这个软件里面是可以改的,在最后画图的过程中,去画图界面的下拉菜单中改。但是本人感觉这个软件的画图非常不人性化,画出的图也不好看。你可以先保存成emf格式,然后在Coredraw或者photoshop里面改。

希望以上回答对你有所帮助
垂死病中惊坐起 一只熊猫出墙来
2楼2013-02-17 07:27:35
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diatom7890

木虫 (正式写手)

不好意思,最近比较忙没有看小木虫,不知道楼主晶晶7777同学的问题解决了没有。
垂死病中惊坐起 一只熊猫出墙来
9楼2013-04-26 00:35:18
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