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tjuexa

新虫 (初入文坛)

[求助] 第一次建立了一个简单的系统发育树,第一次不是很懂,希望各位指正

因为非本专业,所以没人教。我自己建了一个简单的发育树,请大家看看问题出在哪,谢谢各位.我有很多东西不懂,比如在blast中得到近源的菌种,然后又很多都是相似度很高的99%,建树需要怎么选择这些菌种作为对比菌种呢?
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raindick1231

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
这个是不是应该看你的目的是什么?如果是看进化关系,建议下载序列范围覆盖整个基因家族;如果是看功能,建议参考序列范包含各种功能
4楼2013-02-04 19:07:48
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查看全部 6 个回答

rommel1941

铁杆木虫 (正式写手)

情定山河

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
实在是看不到你的图。
你用的序列长度多少?用的什么软件和方法建树?bootstrap多少次?
将相本无种★男儿当自强
2楼2013-02-04 13:51:32
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gaoyang636

木虫 (著名写手)

下载不成功,不知道为什么?lz能不能放在帖子上?
3楼2013-02-04 17:40:43
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q307078056

银虫 (正式写手)

路过学习~
人生不是一种享受,而是一桩沉重异常的工作
6楼2013-02-07 09:07:14
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