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songp295

木虫 (小有名气)


[求助] vasp做MD

各位大侠,刚接触VASP,想用它做一个表面的MD 共90个原子,包含72个金原子,incar如下:
SYSTEM=au2-1
PREC=normal
EDIFF=0.001
IALGO=48  
NWRITE=0
NCORE=8
ENCUT=250   
NELECT=5482
ISPIN=1   
ISMEAR=-1
NELMIN=8
SIGMA=0.05
NSW=200
LREAL=A
LCHARG=F
POTIM=0.5        
IBRION=0
SMASS>=0
TEBEG=298
  
刚计算就跳出,反复修改incar,一直不知道问题在哪里,请大侠指教。
POSCAR, INCAR and KPOINTS ok, starting setup
WARNING: small aliasing (wrap around) errors must be expected
FFT: planning ...(          16 )
--------------------------------------------------------------------------
mpirun noticed that process rank 0 with PID 16369 on node ln038 exited on signal 9 (Killed).
--------------------------------------------------------------------------
  The job was finished at Tue Jan 15 10:52:11 CST 2013
--------------------------------------------------------

OURCAR 一直就停在这里:
WARNING: aliasing errors must be expected set NGX to 130 to avoid them
WARNING: aliasing errors must be expected set NGY to 130 to avoid them
WARNING: aliasing errors must be expected set NGZ to 218 to avoid them
aliasing errors are usually negligible using standard VASP settings
and one can safely disregard these warnings

serial   3D FFT for wavefunctions
parallel 3D FFT for charge:
    minimum data exchange during FFTs selected (reduces bandwidth)
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sunshoutian168

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
fzx2008: 金币+3, 谢谢交流! 2013-01-15 22:21:18
songp295: 金币+5, ★★★很有帮助 2013-01-16 12:57:39
看了你的  INCAR  是不是做带电的体系啊?
SMASS>=0  这样 设置是不对的,要给一个具体的数值  比如0, 1, 2  这几个都是NVT的系综
不同只处在于  设置不同的参数,系综的频率不一样,影响系综和体系的耦合,可以设置为小数,
使得系综的频率和你体系典型的声子频率相同或者相近,所谓的的这个典型的声子频率  就是键的
震动频率,可以搜索一下找到。 具体设置为多少,手册没写,如需要的话奖励我了再告诉你哦。

还有你的体系是导体吗?,如果是的话  这样的 INCAR还缺少几个参数。
Ilovechemistry
2楼2013-01-15 16:48:02
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sunshoutian168

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

Found in the vasp official website:

Nose-frequency (NF) in OUTCAR is in Hz (hertz). To convert it to cm-1 use the formula
NF*33.3567/2 pi (NF is Nose frequency in THz)

NF1/NF2 = sqrt(SMASS2)/sqrt(SMASS1)

按照上述公式 可以换算出来所需要的smass

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

Ilovechemistry
3楼2013-01-16 12:33:41
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songp295

木虫 (小有名气)


送鲜花一朵
引用回帖:
3楼: Originally posted by sunshoutian168 at 2013-01-16 12:33:41
Found in the vasp official website:

Nose-frequency (NF) in OUTCAR is in Hz (hertz). To convert it to cm-1 use the formula
NF*33.3567/2 pi (NF is Nose frequency in THz)

NF1/NF2 = sqrt(SMASS2 ...

非常感谢,是做的金纳米棒上的吸附。昨天测试了,是体系太大的缘故。再按照您的建议进行修改。
刚学习VASP,很多都不懂,谢谢。
4楼2013-01-16 12:59:06
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