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yuxiangrousi

铜虫 (初入文坛)

[求助] 如何分析启动子和哪些转录因子结合

求助各位大牛``
老板希望我分析一个小序列(65bp) 有没有可能是启动子。同时想预测这个启动子和哪些类型的转录因子可以互作,想请问应该用什么软件分析啊。是在真菌中的启动子``
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需要多多吸取知识
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cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
去网上搜下,有在线的软件分析启动子。
2楼2013-01-03 15:12:57
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yuxiangrousi

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by cicelyzh at 2013-01-03 15:12:57
去网上搜下,有在线的软件分析启动子。

您知道有什么不。。 我只看到了植物的 没有专门研究真菌的啊
需要多多吸取知识
3楼2013-01-04 10:36:34
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cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

没注意过真菌。有些是能选物种的,有些只是分析原核生物或者真核生物的。
4楼2013-01-04 11:01:53
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yuxiangrousi

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by cicelyzh at 2013-01-04 11:01:53
没注意过真菌。有些是能选物种的,有些只是分析原核生物或者真核生物的。

具体是哪个软件啊``` 我真是新手  这些都弄不清啊
需要多多吸取知识
5楼2013-01-04 14:24:43
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cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
yuxiangrousi: 金币+3, ★★★很有帮助, 不错不错```还没仔细看```不过感觉很有用~~ 谢谢哟~~~~ 2013-01-05 12:57:36
随便google一下,就能找到很多这样的网站吧。自己试试哪个好用,我没有一一试过。
http://molbiol-tools.ca/Promoters.htm
http://www.shodhaka.com/cgi-bin/ ... omoter%20prediction
......
6楼2013-01-04 15:27:54
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zhang881007

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
NCBI各种资源都有
shine
7楼2013-01-04 16:05:30
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