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fukkim

新虫 (著名写手)

[求助] 上传菌种16S序列时,遇到了下列问题,如何解决?

Please provide the name and version of the chimera checking tool. BLAST alone is not sufficient as a chimera checking tool.

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No pains, no gains.
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3326449

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
6楼: Originally posted by 3326449 at 2013-01-04 10:19:43
提供下chimera检测的软件名称就可以了

检测嵌合体这个东西,程序上是必须的,但我觉得一般的都没人检测,因为只是细菌的16S 又不是很重要的功能基因,你上网google一个检测软件就行了,我记得NCBI有推荐的这个软件
11楼2013-01-04 15:28:00
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55晴朗天天

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

你上传的是细菌的16sRNA吗?
有梦就有希望!想就有可能!
2楼2013-01-03 14:37:21
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fukkim

新虫 (著名写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 55晴朗天天 at 2013-01-03 14:37:21
你上传的是细菌的16sRNA吗?

16SrRNA的基因序列
No pains, no gains.
3楼2013-01-03 15:45:09
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kiruwa

专家顾问 (职业作家)

【答案】应助回帖

找个可以做开没啦check的软件吧。
请注意,照片不是我本人!!!请不要把此人和我的长相联系到一起去.
5楼2013-01-04 01:07:00
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