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bjwang

铁杆木虫 (正式写手)

[求助] wien2k计算scf出现error: command ~/lapw1cpara -c lapw1.def failed

用wien2k_11练习计算石墨烯纳米带,分别尝试了6,10,18个原子系统,用了极少的k点做测试,出现错误都一样。特别STDOUT文件中提示说:insufficient virtual memory,但我的内存是60g的呀,在其他人的服务器上测试是可以的。难道是我编译的问题,我测试自带的SiC那个例子是可以的呀?下面是出错信息,哪位同学帮忙看看问题出在哪?谢谢了!!!
case.dayfile中出现的错误信息:
cycle 1     (Wed Jan  2 13:16:34 CST 2013)  (40/99 to go)

>   lapw0 -p    (13:16:34) starting parallel lapw0 at Wed Jan  2 13:16:34 CST 2013
-------- .machine0 : 16 processors
0.059u 0.086s 2:07.98 0.1%      0+0k 0+0io 14pf+0w
>   lapw1  -c -p        (13:18:42) starting parallel lapw1 at Wed Jan  2 13:18:43 CST 2013
->  starting parallel LAPW1 jobs at Wed Jan  2 13:18:43 CST 2013
running LAPW1 in parallel mode (using .machines)
16 number_of_parallel_jobs
     compute-0-14(6) 18.759u 0.088s 35.34 53.33%      0+0k 0+0io 0pf+0w
     compute-0-14(6) 18.843u 0.052s 38.09 49.60%      0+0k 0+0io 0pf+0w
.............................
**  LAPW1 crashed!
0.613u 1.439s 1:35.86 2.1%      0+0k 0+0io 0pf+0w
error: command   ~/lapw1cpara -c lapw1.def   failed

>   stop error


STDOUT文件中出现的错误信息:
forrtl: severe (41): insufficient virtual memory
Image              PC                Routine            Line        Source
lapw1c             000000000051400D  Unknown               Unknown  Unknown
lapw1c             0000000000512B15  Unknown               Unknown  Unknown
lapw1c             00000000004B3AB0  Unknown               Unknown  Unknown
lapw1c             000000000046D2BA  Unknown               Unknown  Unknown
lapw1c             0000000000497D15  Unknown               Unknown  Unknown
lapw1c             000000000044ADA1  matrices_mp_init_         552  modules_tmp_.F
lapw1c             0000000000411D6E  coors_                    209  coors.f
lapw1c             000000000040DB7D  calkpt_                   144  calkpt_tmp_.F
lapw1c             0000000000431393  MAIN__                     61  lapw1_tmp_.F
lapw1c             0000000000404C1C  Unknown               Unknown  Unknown
libc.so.6          0000003F5CE1D994  Unknown               Unknown  Unknown
lapw1c             0000000000404B29  Unknown               Unknown  Unknown

>   stop error
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It is a shame for the soul to be first to give way in this life,when thy body does not give way.
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bjwang

铁杆木虫 (正式写手)

★ ★ ★
fzx2008: 金币+3, 谢谢分享心得! 2013-01-03 11:10:23
我在FAQ's page找到类似的帖子: lapw1 failed
http://zeus.theochem.tuwien.ac.a ... 1-April/014581.html
说是降低Rkmax 到2.5 (缺省7.0)可以解决这个问题,我尝试了一下,确实如此。但这个代价是以降低精度为代价的,Rkmax=2.5似乎小了点,但在http://www.wien2k.at/reg_user/faq/rmt.html 这个帖子里说“for C-H, O-H or similar bonds: Select the H sphere radius about half of it's partner (typically C: 1.2, H: 0.6 bohr). Reduce RKMAX (3-4 might be sufficient; check!), increase GMAX (case.in2) to 20.”
欢迎其他同学交流指正!
It is a shame for the soul to be first to give way in this life,when thy body does not give way.
2楼2013-01-02 19:01:52
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nyoxd

银虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by bjwang at 2013-01-02 19:01:52
我在FAQ's page找到类似的帖子: lapw1 failed
http://zeus.theochem.tuwien.ac.at/pipermail/wien/2011-April/014581.html
说是降低Rkmax 到2.5 (缺省7.0)可以解决这个问题,我尝试了一下,确实如此。但这个代 ...

查看一下lapw1.error是什么原因吧
3楼2013-03-31 11:07:20
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xiaoyukaka

木虫 (正式写手)

你好,我也碰到过类似问题,
lapwso crashed!
~/lapwsopara lapwso.def   failed
但我在单机上用极少k点计算就可以,似乎问题是出在并行上。
你可以尝试一下用极少k点单机算,我个人感觉是由于超算并行脚本和wien2k不兼容的问题,或者没有设置好。
相互交流,
4楼2013-10-23 21:02:55
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