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lei234

新虫 (小有名气)

[求助] IRC

跑完IRC后,拿得到的结构去优化,得到的结构和IRC得到的结构不一样了,是怎么回事?
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schalke

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与,应助指数 +1
gmy1990: 金币+1 2012-12-20 18:03:25
IRC是一个结构变化过程,你使用的是哪个结构去优化?IRC的初始结构一般为过渡态结构,不知道你是不是用过渡态结构去做minimum优化了
2楼2012-12-20 10:41:52
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t13340033021

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
IRC有没跑到头,不一样正常
甲烷无敌
3楼2012-12-20 12:12:42
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wangsihang

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
如果差别很大,你觉得不合理,那你就让IRC多跑几步,然后在优化试试。
4楼2012-12-20 14:44:17
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lei234

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by schalke at 2012-12-20 10:41:52
IRC是一个结构变化过程,你使用的是哪个结构去优化?IRC的初始结构一般为过渡态结构,不知道你是不是用过渡态结构去做minimum优化了

是过渡态作为初始结构呀
5楼2012-12-20 14:47:18
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lei234

新虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by wangsihang at 2012-12-20 14:44:17
如果差别很大,你觉得不合理,那你就让IRC多跑几步,然后在优化试试。

产物直接变了...
还有一个问题,我做了forward 和reverse,怎么两个得出的结构一样了,神了.....
6楼2012-12-20 14:49:38
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luosizuo

禁虫 (小有名气)

★
感谢参与,应助指数 +1
gmy1990: 金币+1 2012-12-20 18:03:36
本帖内容被屏蔽

7楼2012-12-20 15:14:53
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wangsihang

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
cenwanglai: 金币+1, 谢谢参与~ 2012-12-21 10:30:58
lei234: 金币+5, ★★★很有帮助 2012-12-21 15:51:09
有的时候确实可以找到相同的物质,如果你的模型比较大,建议你调节频率不用IRC。
8楼2012-12-20 18:47:16
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lei234

新虫 (小有名气)

我只好把距离稍微拉大一点儿,先固定优化,然后读力常数放开优化,又出现了Error in internal coordinate system错误。。。。
9楼2012-12-23 10:03:21
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