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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 综合其他 » 是不是新发现了一种真菌？
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mengxibio

新虫 (小有名气)

[交流] 是不是新发现了一种真菌？ 已有2人参与

海洋里新分离到一个物种，平板已经形成单菌落。16s通用引物pcr扩增没条带，用真菌通用的its引物扩，有条带，送测序，但是返回来的测序结果，ncbi比对，竟然完全找不到记录信息。扩增的是its1，是新发现了一种真菌吗？
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1楼 2012-12-13 19:11:08
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mengxibio

新虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by kiruwa at 2012-12-14 12:46:31
我也有这种情况,我觉得不是啥新菌,可能这种菌的ITS没被人研究过吧.你准备怎么report呢.

哦，这个不是我目前手头上的活。是帮其他实验室做的一点东西。
当时他们怀疑是某种真菌，然后我就先对its1看了下
打算还是要看下18s的信息吧。因为当时手头上只有its的引物
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6楼2012-12-14 13:03:51
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zq347597638

新虫 (小有名气)
★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
laozuzunzhe: 金币+1, 鼓励应助 2012-12-14 17:13:26
有的时候测序也不是完全正确的 楼主可以把样品送两家或以后的公司测序比对  
或者再用另外一对通用引物PCR  看看两者之间得出来的结果再下判断
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3楼2012-12-14 08:44:50
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mengxibio

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by kiruwa at 2012-12-14 02:04:51
不是

哦，那可能原因是什么呢？
前面一小段能贴上的是18s的末尾，后面一段能贴上的是5.8s部分，但是中间的这段its没有记录信息

未命名.jpg
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4楼2012-12-14 12:41:49
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kiruwa

专家顾问 (职业作家)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
我也有这种情况,我觉得不是啥新菌,可能这种菌的ITS没被人研究过吧.你准备怎么report呢.
赞一下 回复此楼
请注意,照片不是我本人!!!请不要把此人和我的长相联系到一起去.
5楼2012-12-14 12:46:31
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