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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » HyperChem/NWChem » HyperChem中如何以球、棍的形式显示原子
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xqtian

新虫 (初入文坛)

[求助] HyperChem中如何以球、棍的形式显示原子

HyperChem中如何以球、棍的形式显示原子？默认的显示形式是以细线显示化学键。
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1楼 2012-12-12 12:37:25
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flyonsea

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
cenwanglai: 金币+2, 谢谢回复~ 2012-12-25 11:13:37
依次点击display-rendering-balls and cylinders即可，也可变为其他的显示模式
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2楼2012-12-25 11:03:53
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keke1987

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by flyonsea at 2012-12-25 11:03:53
依次点击display-rendering-balls and cylinders即可，也可变为其他的显示模式

请问你知不知道怎么把Hyperchem优化后的水盒子（包括里面所有的水分子）删除掉？要是想继续用GussianView 计算要怎么保存结果的格式呢？
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3楼2013-01-07 12:43:36
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flyonsea

木虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by keke1987 at 2013-01-07 12:43:36
请问你知不知道怎么把Hyperchem优化后的水盒子（包括里面所有的水分子）删除掉？要是想继续用GussianView 计算要怎么保存结果的格式呢？...

你的意思是不是只要保留目标分子？那么可以保存为xyz格式的文件，用文本编辑器（比如ultraedit等）打开，把后面的H2O分子删掉可以得到目标分子的坐标。剩下的应该好办了吧。
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4楼2013-01-07 19:21:10
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keke1987

新虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by flyonsea at 2013-01-07 19:21:10
你的意思是不是只要保留目标分子？那么可以保存为xyz格式的文件，用文本编辑器（比如ultraedit等）打开，把后面的H2O分子删掉可以得到目标分子的坐标。剩下的应该好办了吧。...

谢谢！这个我已经解决了。再有就是我想问问你知不知道用Hyperchem软件可以对接吗？两个分子以上的对接可以吗？
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5楼2013-01-08 08:45:29
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2011xiaona

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by flyonsea at 2012-12-25 11:03:53
依次点击display-rendering-balls and cylinders即可，也可变为其他的显示模式

请问用球棍形式表示分子后，可以调整原子的直径吗？（想把某些原子直径调大）
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6楼2013-05-21 10:30:42
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