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一天2043

木虫 (小有名气)


[交流] 关于dbSNP数据批量下载的疑问

我想下载人类的SNP数据,本科化学,现在研一转为生物信息学专业,第一次下载数据,而且是批量的,希望牛人们指点!!!谢谢
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一天2043(金币+1): 谢谢参与
一天2043: 金币+10 2012-12-10 16:05:45
dbSNP是我感觉比较复杂的一个数据库,还不知道怎么用。下载方便,去NCBI FTP站点就可以
3楼2012-12-10 02:03:52
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userhung

禁虫 (文学泰斗)



一天2043(金币+1): 谢谢参与
到网页应该有批量下载点的哦,祝福好运~~~~~~~~~~~
4楼2012-12-10 08:07:13
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一天2043

木虫 (小有名气)


引用回帖:
3楼: Originally posted by wizardfan at 2012-12-10 02:03:52
dbSNP是我感觉比较复杂的一个数据库,还不知道怎么用。下载方便,去NCBI FTP站点就可以

dbSNP不就在NCBI上么?
6楼2012-12-10 16:04:17
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一天2043

木虫 (小有名气)


★ ★
wizardfan: 金币+2, 版主也不是万能的:) 2012-12-11 08:48:28
引用回帖:
3楼: Originally posted by wizardfan at 2012-12-10 02:03:52
dbSNP是我感觉比较复杂的一个数据库,还不知道怎么用。下载方便,去NCBI FTP站点就可以

亲爱的版主,期待你有价值的回复啊
7楼2012-12-10 16:05:34
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小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
7楼: Originally posted by 一天2043 at 2012-12-10 16:05:34
亲爱的版主,期待你有价值的回复啊...

我带过一个学生,她不会弄,我简单的看了下,觉得太复杂,就选择了用swissprot中的variation。当然,我们处理的是蛋白质数据,DNA的话,估计只能看这个dbSNP了。下载地址ftp://ftp.ncbi.nih.gov/snp/ (就是我上面说的NCBI FTP站点,简单的搜索就可以了),先看里面的00readme.txt,然后根据你的要求选择数据下载
8楼2012-12-10 16:54:57
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一天2043

木虫 (小有名气)


引用回帖:
8楼: Originally posted by wizardfan at 2012-12-10 16:54:57
我带过一个学生,她不会弄,我简单的看了下,觉得太复杂,就选择了用swissprot中的variation。当然,我们处理的是蛋白质数据,DNA的话,估计只能看这个dbSNP了。下载地址ftp://ftp.ncbi.nih.gov/snp/ (就是我上面 ...

谢谢 版主 自己研究呢
10楼2012-12-12 15:39:47
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秋lover

银虫 (小有名气)


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小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
一天2043: 金币+6 2012-12-14 12:52:27
貌似只可以一条一条地下吧
11楼2012-12-12 15:49:27
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简单回复
2012-12-10 01:02   回复  
一天2043(金币+1): 谢谢参与
2012-12-10 08:22   回复  
一天2043(金币+1): 谢谢参与
2012-12-10 22:03   回复  
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