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摘 要:【目的】为了研究新疆拜城盐山环境中的细菌多样性,为今后的开发和利用奠定基础。【方法】应用基于16SrRNA基因序列的免培养技术和系统发育分析方法对拜城盐山样品中的细菌多样性进行研究。采用SDS-CTAB方法提取样品中的总DNA,利用特异性引物扩增样品DNA中的细菌16SrRNA基因,并构建细菌16SrRNA基因克隆文库;通过比较酶切图谱,挑选克隆文库中的代表克隆,进行序列测定和BLAST比对分析。【结果】构建的细菌克隆文库共包含291个细菌克隆。克隆序列经过BLAST比对分析,细菌亚纲中的克隆位于变形菌门中的克隆有183个,占到了细菌总克隆数的62.9%。其中δ-变形菌纲中的克隆数79个,是该环境的优势菌群,γ-变形菌纲中的克隆数52个,α-变形菌纲中的克隆数28个,β-变形菌纲中的克隆数24个。可以推测该盐山环境中变形菌门的细菌种类分布较为广泛。酸杆菌门55个克隆,占总克隆数18.9%,在该盐山环境中也有着广泛分布。厚壁菌门和拟杆菌门各16个克隆,绿弯菌门14个克隆,在盐山环境中分布较少。硝化螺旋菌门3个克隆,浮霉菌门2个克隆,芽单胞菌门2个克隆,属于稀有细菌类群。大多数的序列与已有效发表菌株的序列相似性小于97%,在系统发育树上能够形成独立的进化分支,可能代表着新的细菌类群,因此盐山环境是发现新细菌物种的理想之地。【结论】研究结果表明拜城盐山存在着较为丰富的细菌种类,并且潜藏着新类型的细菌资源。 关键词:拜城盐山;细菌多样性;免培养方法 |
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