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sweety0807

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
10楼: Originally posted by luosizuo at 2012-12-07 12:26:27
你把log文件贴出来看看吧!B3LYP/6-31G算没问题,B3LYP/6-31G(d)一般计算不会有问题。现在不知道你问题出在什么地方

这是LOG文件
nobrhbondd20121206.log(206.03KB)
http://kuai.xunlei.com/d/GOZCFJRWITQH?p=130497
11楼2012-12-07 12:59:07
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luosizuo

禁虫 (小有名气)

本帖内容被屏蔽

12楼2012-12-07 16:22:38
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sweety0807

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
12楼: Originally posted by luosizuo at 2012-12-07 16:22:38
这么大的分子没做过,可能是收敛次数太少了。可以试着增加点,MaxCycle=N 把N稍微增加。如果再不行我就不好说了

请问MaxCycle在哪里改啊?
13楼2012-12-07 19:31:44
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luoduoxc

铜虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
做 Opt 你的体系还比较大,为啥不直接用B3LYP/6-31G(d)呢?直接用试试
寻找唯一,追求唯一,享受唯一!
14楼2012-12-07 19:59:01
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sweety0807

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
14楼: Originally posted by luoduoxc at 2012-12-07 19:59:01
做 Opt 你的体系还比较大,为啥不直接用B3LYP/6-31G(d)呢?直接用试试

不是先优化一下计算量会小点吗?之前直接做过,由于构型太差了,也报错了,不做B3LYP/6-31G直接做B3LYP/6-31G(d)也行?那我试试看。
15楼2012-12-07 22:34:52
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t13340033021

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
都没给出9999.说明是程序异常终止了,如果你是用的集群,看看.err文件。
甲烷无敌
16楼2012-12-08 13:54:31
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sweety0807

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
16楼: Originally posted by t13340033021 at 2012-12-08 13:54:31
都没给出9999.说明是程序异常终止了,如果你是用的集群,看看.err文件。

Thu Dec  6 22:14:14 CST 2012
Error: hangup
   rax 0000000000a2b438, rbx 0000000000000006, rcx 00000000000000d6
   rdx 00000000001d1494, rsp 00007fff45569fb0, rbp 00007fff4556a250
   rsi 0000000000000001, rdi 0000000000000001, r8  0000000000000014
   r9  000000000008be0e, r10 00002b25592f9a60, r11 00002b255c1b2fa0
   r12 0000000000000000, r13 00007fff4556cd78, r14 0000000000000073
   r15 0000000000000073
Error: hangup
   rax fffffffffffffffc, rbx 0000000000000000, rcx ffffffffffffffff
   rdx 0000000000000000, rsp 00007fff9bb04370, rbp 00007fff9bb044fc
   rsi 00007fff9bb044fc, rdi 0000000000007c9d, r8  00007fff9bb04390
   r9  00000038cb952780, r10 0000000000000000, r11 0000000000000246
   r12 0000000000007c9d, r13 00007fff9bb04430, r14 0000000000000000
   r15 00007fff9bb07dc0
  --- traceback not available
  --- traceback not available
./run.p.sh: line 2: 31900 Aborted                 g09 ./nobrhbondd20121206.gjf
Thu Dec  6 22:23:57 CST 2012
这个是.out文件,能看出是哪出了问题吗?没有.err文件
17楼2012-12-08 15:44:10
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t13340033021

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

log文件没有报错就终止在l502,并且前面l502也收敛成功了,会不会是你任务设置了最大运行时间。
甲烷无敌
18楼2012-12-08 19:54:43
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sweety0807

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
18楼: Originally posted by t13340033021 at 2012-12-08 19:54:43
log文件没有报错就终止在l502,并且前面l502也收敛成功了,会不会是你任务设置了最大运行时间。

你好,我不是研究分子模拟的,所以对这些也不是很懂,你说的最大运行时间在哪能看到是否设置了?谢谢
19楼2012-12-08 20:26:39
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