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追梦的人1987

金虫 (小有名气)

[求助] 求助

有个问题请教一下,我现在有一个原株,两个突变株,其中,一个突变株某种物质的表达量上升,某种表达量下降,我现在通过双向来看相关蛋白双向来看表达量得上调或下降,来克隆与能高量表达该物质的基因,这样的话,我在筛选蛋白双向的的点时,该如何做呢
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cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

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追梦的人1987: 金币+5, 有帮助 2012-12-03 10:59:21
把对照、上升、下降的样品都跑双向,然后对比三个样品,选出原株表达量在中间,两个突变株一个上升,一个下调的点,挖点打质谱。

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2楼2012-12-03 04:00:43
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追梦的人1987

金虫 (小有名气)

送鲜花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by cicelyzh at 2012-12-03 04:00:43
把对照、上升、下降的样品都跑双向,然后对比三个样品,选出原株表达量在中间,两个突变株一个上升,一个下调的点,挖点打质谱。

我还想问一下,因为经费问题,我们一个样品只做了两个重复,这样的话,有的组内差距较大,我想的就是组内差距在多少之内是可以接受的呢,(无法做三个重复啊,没法做统计学分析)
3楼2012-12-03 11:01:05
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cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 追梦的人1987 at 2012-12-03 11:01:05
我还想问一下,因为经费问题,我们一个样品只做了两个重复,这样的话,有的组内差距较大,我想的就是组内差距在多少之内是可以接受的呢,(无法做三个重复啊,没法做统计学分析)...

通常做定量的话至少要有三个重复。一般是至少跑4个胶,取重复性好的三个。差距多少proteomics的文献上都有要求。总之,尽量严格控制实验条件,重复数据平行才能说明问题。
4楼2012-12-03 12:21:00
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