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南方科技大学公共卫生及应急管理学院2026级博士研究生招生报考通知(长期有效)
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sonny

金虫 (著名写手)

[求助] 新药研发中评估小分子化合物极性的Log P疏水常数的意义是什么?

最近我们合成出来一中化合物B,疏水常数Log P=3.21, 其母体化合物A的Log P=-1.51。但是,相对于母体化合物A,我们的化合物B表现出更加强烈的诱导细胞凋亡的能力。我想知道这两个数值在评估我的新化合物的价值方面,代表什么意义?如果说数值越大,代表疏水性越强,我想了解一下一般新药开发过程中这个数值允许的的尺度有多大呢?或者亲爱的虫友们给我提供一些资料,我自己学习一下!先谢谢大家了!
    最近在投文章,毕业,修改意见里要我解释的问题设计到这些内容,我不是学化学的,所以不是很懂,着急啊,希望大家帮帮忙!感激不尽!
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catwithdog

新虫 (初入文坛)


【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
marktiger: 金币+2, 欢迎参与,欢迎常来。 2012-11-28 08:34:52
sonny: 金币+5, ★★★★★最佳答案 2012-11-28 11:20:53
sonny: 回帖置顶 2012-11-28 11:21:08
For your reference:

1.        我想了解一下一般新药开发过程中这个数值允许的的尺度有多大呢?
Based on Lipinski's Rule of Five,  log P in −0.4 to +5.6 range will be ideal drug. So your compounds are good.
2.        我想知道这两个数值在评估我的新化合物的价值方面,
First, you need understand what is Log P. LogP , partition (P) coefficient , is the ratio of concentrations of a compound in a mixture of two immiscible phases at equilibrium. These coefficients are a measure of the difference in solubility of the compound in these two phases. Normally one of the solvents chosen is water while the second is hydrophobic such as octanol. Hence both the partition and distribution coefficient are measures of how hydrophilic ("water-loving" or hydrophobic ("water-fearing" a chemical substance is.
Log P = log (compound in Octanol/ compound in water)

So, 母体化合物A的Log P=-1.51,  is less  hydrophobic than 化合物B, Log P=3.21. In another word, 化合物B疏水性强.

3.        代表什么意义?
In medical practice, partition coefficients are useful for example in estimating distribution of drugs within the body. Hydrophobic drugs with high octanol/water partition coefficients are preferentially distributed to hydrophobic compartments such as lipid bilayers of cells while hydrophilic drugs (low octanol/water partition coefficients) preferentially are found in hydrophilic compartments such as blood serum.
So 化合物B may have more distribution in lipid bilayers of cells which may be your target place. (that's only we guess)
4楼2012-11-28 03:28:20
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cpujacs

荣誉版主 (知名作家)

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marktiger: 金币+1, 欢迎参与,欢迎常来。 2012-11-28 08:35:10
sonny: 回帖置顶 2012-11-28 11:21:00
引用回帖:
4楼: Originally posted by catwithdog at 2012-11-28 03:28:20
For your reference:

1.        我想了解一下一般新药开发过程中这个数值允许的的尺度有多大呢?
Based on Lipinski's Rule of Five,  log P in −0.4 to +5.6 range will be ideal drug. So your compounds are  ...

The logP value of a compound, which is the logarithm of its partition coefficient between n-octanol and water log(coctanol/cwater), is a well established measure of the compound's hydrophilicity. Low hydrophilicities and therefore high logP values cause poor absorption or permeation. It has been shown for compounds to have a reasonable propability of being well absorbt their logP value must not be greater than 5.0. The distribution of calculated logP values of more than 3000 drugs on the market underlines this fact (see diagram)

cLogPDis.gif

5楼2012-11-28 08:27:09
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heyongyao

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

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marktiger: 金币+1, 欢迎参与,欢迎常来。 2012-11-28 08:34:25
sonny: 金币+2 2012-11-28 11:18:44
不做有机合成,真不好解释给你。就是判断分子的脂溶性和水溶性,初步判断化合物的溶解性-生物利用度
2楼2012-11-28 00:23:04
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heyongyao

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
marktiger: 金币+1, 欢迎参与,欢迎常来。 2012-11-28 08:34:31
sonny: 金币+2 2012-11-28 11:18:50
就是透过细胞膜的特性,很显然B的细胞透过能力强于A
3楼2012-11-28 00:24:24
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yiwenbin

禁虫 (正式写手)


marktiger: 金币+1, 欢迎参与,欢迎常来。下次可以选择应助回帖哈。 2012-11-29 08:15:06
本帖内容被屏蔽

6楼2012-11-28 08:45:16
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yylex

捐助贵宾 (正式写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
sonny: 金币+1 2012-11-28 11:22:36
就是透过细胞膜的特性,很显然B的细胞透过能力强于A
7楼2012-11-28 09:10:21
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sonny

金虫 (著名写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by catwithdog at 2012-11-28 03:28:20
For your reference:

1.        我想了解一下一般新药开发过程中这个数值允许的的尺度有多大呢?
Based on Lipinski's Rule of Five,  log P in −0.4 to +5.6 range will be ideal drug. So your compounds are  ...

那我是否可以理解我化合物B更容易进入细胞来发挥药效呢?
这位仁兄的解释很全面,能够给我提供一些相关的文献呢?我想好好看一下,或者引用一下再文章中?谢谢了!
8楼2012-11-28 11:34:29
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catwithdog

新虫 (初入文坛)


那我是否可以理解我化合物B更容易进入细胞来发挥药效呢?
Theoretically you can explain it in this way for your paper.

这位仁兄的解释很全面,能够给我提供一些相关的文献呢?我想好好看一下,或者引用一下再文章中?谢谢了!
Sorry, I don’t have this reference on hand now.
9楼2012-11-29 04:55:00
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