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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » 为什么建模之后，盒子里面的分子中原子都散了。
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zxl523

金虫 (著名写手)

[求助] 为什么建模之后，盒子里面的分子中原子都散了。

我用MD建了个盒子，出来的分子结构中原子都是散的，原来的键都没有了，而且也不在原来的位置了都散开了，这是怎么回事呢？？？
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itisagoodtime.
1楼 2012-11-26 16:35:34
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tylgd2011

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
zxl523: 金币+2 2012-11-28 09:00:43
你是选择的分数坐标还是笛卡尔坐标？你试着换换坐标。
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4楼2012-11-27 09:42:13
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春雷和凌子

木虫 (小有名气)

研究员

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
jiaoyixiong: 金币+1, 鼓励交流 2012-11-26 19:43:41
zxl523: 金币+2 2012-11-28 09:00:37
连键参数没写好，或者 形式错误，md程序压根就不认。
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2楼2012-11-26 17:27:16
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zxl523

金虫 (著名写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 春雷和凌子 at 2012-11-26 17:27:16
连键参数没写好，或者 形式错误，md程序压根就不认。

是键完之后 ，已经都优化完了。
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itisagoodtime.
3楼2012-11-27 08:54:25
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zxl523

金虫 (著名写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by tylgd2011 at 2012-11-27 09:42:13
你是选择的分数坐标还是笛卡尔坐标？你试着换换坐标。

我已经找到错误了，谢谢。
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itisagoodtime.
5楼2012-11-28 09:00:10
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