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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Monte Carlo » MCsportion里fixed pressure运行完以后模型可以用到MD里吗？
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tylgd2011

铁杆木虫 (正式写手)

[求助] MCsportion里fixed pressure运行完以后模型可以用到MD里吗？

MCsportion里fixed pressure运行完以后模型可以用到MD里吗？怎么操作。非常感谢，如提供马上兑现们决不拖欠。再次谢谢。
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1楼 2012-11-21 18:02:15
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xujc1983

木虫 (著名写手)

苦逼青椒一枚

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
zh1987hs: 金币+1, 谢谢 2012-11-23 12:55:44
可以，打开跑完的结构，然后在Forcite中设置相关参数即可
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2楼2012-11-22 12:50:16
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zyj8119

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
zh1987hs: 金币+1, 谢谢 2012-11-23 12:55:49
你一般准备用什么系综跑MD?是准备用NVT-MD还是NVE-MD,还是先NVE-MD，后NVT-MD?
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好好学习，天天向上。
3楼2012-11-23 10:54:56
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tylgd2011

铁杆木虫 (正式写手)
sorption里出来的图是吸附物质最佳的分布图，看不到实体只有概率分布图，假如MD模拟，最终结果怎么分析？这是我最困惑的地方，我准备用MS-MD-NVT模拟。谢谢。再就是做吸附是不是必须的MD模拟，刚做sorption这块可以写论文吗？
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4楼2012-11-25 21:32:25
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zyj8119

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★
chaizhm: 金币+1, 谢谢~ 2012-11-26 22:34:16
引用回帖:
4楼: Originally posted by tylgd2011 at 2012-11-25 21:32:25
sorption里出来的图是吸附物质最佳的分布图，看不到实体只有概率分布图，假如MD模拟，最终结果怎么分析？这是我最困惑的地方，我准备用MS-MD-NVT模拟。谢谢。再就是做吸附是不是必须的MD模拟，刚做sorption这块可以 ...

有low energy snapshots的，拿这个做MD就好。。。
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好好学习，天天向上。
5楼2012-11-26 20:56:42
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tylgd2011

铁杆木虫 (正式写手)
非常感谢！
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6楼2012-11-27 09:38:14
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