24小时热门版块排行榜    

查看: 1484  |  回复: 2

twx6616

铜虫 (初入文坛)

[求助] 关于基因芯片数据处理及软件的问题

1.基因芯片数据的预处理,是否将所有数据进行log2处理以接近正态保证后续分析?
2.生物学重复,是否可以理解为一个种类中,随机抽取三个个体分别进行实验?而不是一个个体做三次。
3.正常和逆境分别处理,这里应该是一个因素,如不考虑种类区别,只看基因在一个种类下正常与逆境的区别,这里应该是用T检验吧?
4.在EXCEL表格里做的,这里面怎么做方差同性呢?用什么函数?
5.如考虑不同种类,是否应该是方差分析来做?相当于多了一个因素。有同学说,两因素就必须用方差分析。
6.软件问题,SAM为什么在win764位装就报错说文件受损请换个新的COPY,这已经是最新的了?有谁在该系统下成功安装还是必须换系统?

转行搞生物的,很多不懂的问题大家不要见笑,只希望踏踏实实从零开始,不想留一点疑问,希望各位高人赐教,不胜感激!
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xiejmseu

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
wizardfan: 金币+5, 应助指数+1, excellent answers, bioconductor is a good choice. Please keep doing this. 2012-11-29 00:22:04
1. 一般进行log处理
2. 是的,选择三个同类个体进行生物学重复。 一个个体做三次叫技术性重复。
3. 一般用T检验
4. 不熟悉,ANNOVA?
5. 一般用方差分析
6、 没有用过。

试试用R-bioconductor中的SAMR分析。对于大数据量,用excel分析不是太方便啊。
2楼2012-11-28 14:56:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhangjunpeng

至尊木虫 (知名作家)

【答案】应助回帖

内容已删除
北冥有鱼,其名为鲲。鲲之大,不知其几千里也。化而为鸟,其名为鹏。鹏之背,不知其几千里也。怒而飞,其翼若垂天之云。是鸟也,海运则将徙于南冥。南冥者,...
3楼2013-01-28 12:22:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 twx6616 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 cBGhfJFuNMca 2026-08-02 9/450 2026-08-02 16:32 by jHcrHMhbKCFV
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 cBGhfJFuNMca 2026-08-02 15/750 2026-08-02 16:32 by jHcrHMhbKCFV
[博后之家] 售SCI一区文章,我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +3 cBGhfJFuNMca 2026-08-02 15/750 2026-08-02 16:31 by jHcrHMhbKCFV
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 cBGhfJFuNMca 2026-08-02 13/650 2026-08-02 16:27 by jHcrHMhbKCFV
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 cBGhfJFuNMca 2026-08-02 19/950 2026-08-02 16:24 by jHcrHMhbKCFV
[博后之家] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 cBGhfJFuNMca 2026-08-02 19/950 2026-08-02 16:23 by jHcrHMhbKCFV
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 cBGhfJFuNMca 2026-08-02 15/750 2026-08-02 16:23 by jHcrHMhbKCFV
[考博] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 cBGhfJFuNMca 2026-08-02 19/950 2026-08-02 16:21 by jHcrHMhbKCFV
[基金申请] 面上提前没消息,有中的吗 +9 archvillain 2026-08-02 11/550 2026-08-02 15:44 by alexon
[找工作] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 cBGhfJFuNMca 2026-08-02 12/600 2026-08-02 13:43 by jHcrHMhbKCFV
[找工作] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 cBGhfJFuNMca 2026-08-02 16/800 2026-08-02 13:34 by jHcrHMhbKCFV
[基金申请] 2026年国自然面上资助率 +15 布布和一二 2026-07-30 21/1050 2026-08-02 10:56 by iaeyuan
[教师之家] 基础研究怎么拉横向,学校到款任务越来越多,难以完成 拉横向,都有哪些途径啊 +8 锦衣卫寒战 2026-07-28 10/500 2026-08-02 10:00 by 锦衣卫寒战
[基金申请] 微信指数没变化,科研之友没阅读 +14 wangze12014 2026-07-28 18/900 2026-07-31 18:35 by lzchaihuo
[高分子] HXDI做水性聚氨酯乳液,是不是特别容易出渣 15+3 yuyusuv 2026-07-29 3/150 2026-07-31 09:21 by huizingga
[基金申请] 系统今天又提示维护了,估计离放榜不远了 +11 winnerche 2026-07-29 15/750 2026-07-30 23:08 by jnhyjjm
[基金申请] 你们的时间戳变了吗 +3 archvillain 2026-07-30 4/200 2026-07-30 18:53 by levinzhwen
[有机交流] 产物和副产物价值比较 30+4 小汤02 2026-07-27 5/250 2026-07-30 12:44 by czyzsu
[基金申请] 这种情况还有戏吗 +5 drbart 2026-07-27 11/550 2026-07-29 05:50 by drbart
[基金申请] 同事接到电话了,我却没有 +4 1234567wang 2026-07-27 4/200 2026-07-28 10:11 by GOODLUCKER
信息提示
请填处理意见