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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » 专家会诊 » DOCK6.5做柔性对接时间问题
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cfmzxf84

木虫 (正式写手)

[求助] DOCK6.5做柔性对接时间问题

请教下各位，我用DOCK6.5做对接，柔性对接的时间比做刚性对接的时间短很多，并且按redocking来看效果也没有刚性的好。均用的官网上的教程in文件
请问DOCK的柔性对接in文件应该怎么写呢？ 我觉得柔性的时间应该比刚性久才对啊。谢谢

[ Last edited by cfmzxf84 on 2012-11-16 at 21:42 ]
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1楼 2012-11-16 21:39:45
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NicoleDH

银虫 (小有名气)
楼主，你好。我是dock新手，做dock的时候总是出现这样的问题：ERROR:  Could not complete growth.
                                                                                         Confirm that the grid box is large enough to contain the ligand,
                                                                                         and try increasing max_orientations.
可以请教一下怎么解决吗？方便QQ联系一下吗？非常感谢！
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你所谓的艰难正是别人出类拔萃的资本。
2楼2017-08-18 10:10:03
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