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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » gaussian程序中怎么拉伸一个分子或者分子链
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搁浅蛟

木虫 (正式写手)

[求助] gaussian程序中怎么拉伸一个分子或者分子链

如题，需要计算一个分子（非双原子分子）或者分子链（一维周期体系）的弹性模量，需要计算其能量与应变的关系，需采用步进扫描来计算分子的势能面。可是疑问如下：分子的长度每增加一步，按理gaussian都会优化到对应于该长度的能量最低点，但是此时的截止标准怎么定？因为此时的能量最低点并不是自然状态下的最低点，而是拉伸状态下的最低点。我该采用什么样的命令输入行？
    请各位高手不吝赐教，只要能解决问题，金币不是问题。
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1楼 2012-11-14 09:47:29
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chembetsey

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
cenwanglai: 金币+1, 谢谢回复~ 2012-11-14 14:43:38
搁浅蛟: 金币+5, ★有帮助 2012-11-15 12:41:23
你这种扫描用Opt=ModRedun就可以了。去读读高斯手册的Opt关键字部分。
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2楼2012-11-14 10:35:39
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gauss98

禁虫 (正式写手)
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
cenwanglai: 金币+2, 谢谢~ 2012-11-14 14:43:57
搁浅蛟: 金币+15, ★★★很有帮助 2012-11-15 12:40:53
本帖内容被屏蔽
3楼2012-11-14 11:05:45
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搁浅蛟

木虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by chembetsey at 2012-11-14 10:35:39
你这种扫描用Opt=ModRedun就可以了。去读读高斯手册的Opt关键字部分。

谢谢指点，我仔细的看过opt关键词，modRedun这部分看不懂，尤其是最后的单独分子说明部分，如[Type] N1 [N2 [N3 [N4]]]等命令都不理解到底什么意思？我记得MOPAC里边有很简单的命令，只需要指明变量、步长和扫描次数就行了。
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4楼2012-11-14 11:11:38
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gauss98

禁虫 (正式写手)
本帖内容被屏蔽
5楼2012-11-14 11:31:02
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yanrding

金虫 (正式写手)
★
cenwanglai: 金币+1, 谢谢参与~ 2012-11-14 14:44:16
有趣的工作，要用AFM测分子的力常数吗？
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华北电力大学（北京）数理学院，计算化学，凝聚态物理。欢迎合作！招硕士/博士研究生，招老师。
6楼2012-11-14 11:38:01
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搁浅蛟

木虫 (正式写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by gauss98 at 2012-11-14 11:31:02
type 就是任务类型

在我给你的例子中

3 12 5.58 S 50 0.1

S 就是 type， 扫描scan 的意思

键长只含两个原子，3 是 N1 ， 12 是 N2 ，
如果是键角 就有三个原子， 二面角 就是 4个原子（N1,N2,N3,N4) ...

谢谢gauss98的指点，让我对N1,N2,N3,N4比较熟悉了，不过关于我的问题还是有不少疑问，就如下图所示的梯形分子及梯形分子链，沿箭头方向拉伸的势能面扫描该怎么做？它涉及的原子可不是四个原子这么少，而是主链中所有的原子。

梯形分子链.jpg
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7楼2012-11-14 12:40:55
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gauss98

禁虫 (正式写手)
本帖内容被屏蔽
8楼2012-11-14 13:09:00
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