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错爱一生

新虫 (初入文坛)

[求助] 生物信息学求助:如何利用NCBI寻找启动子?

现从ncbi上寻找到目标基因,他的cds序列是在他注释的这个基因的第16个碱基开始的,他的前端序列太短,必须在其基因组中寻找启动子,如何在NCBI上在他的基因组中寻找到他的启动子序列,或是有其他的方法,敬请告知;还有就是该基因他转录了两个mRNA,查文献得知在该基因上存在两个启动子,是由不同启动子控制转录,而非由同一启动子控制转录后的两种不同剪接方式,这又如何来鉴别,求大神们帮助解决,小弟万分感谢。。。。
下面有个附件,是从ncbi上下载的基因序列,他标注了他能转录出的两个mRNA。。。一个是fasta格式的   一个是gb格式的。。。
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  • 附件 1 : bd-s-1-dna.fasta
  • 2012-11-12 15:55:35, 5.39 K
  • 附件 2 : bd-s-1-dna.gb
  • 2012-11-12 15:55:58, 12.85 K

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