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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » MS任务-------pbs作业脚本 计算光学 声子性质出错？？？
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pengliusss

木虫 (小有名气)

[求助] MS任务-------pbs作业脚本 计算光学 声子性质出错？？？

大家好，交流下pbs使用遇到的问题，多谢！
前面声明语句。。。。。
#PBS -q bl64Grack128G

project_name=pbss

cd $PBS_O_WORKDIR
NSLOTS=`cat${PBS_NODEFILE}|wc -l`

/public/software/hpmpi/bin/mpirun -TCP -e MPI_REMSH=/usr/bin/ssh -np $NSLOTS -hostfile $PBS_NODEFILE /public/home/ms/Accelrys/MaterialsStudio44/bin/castepexe_mpi.exe  $project_name

     mv  "$project_name.check  "$project_name"_Optics.check

/public/software/hpmpi/bin/mpirun -TCP -e MPI_REMSH=/usr/bin/ssh -np $NSLOTS -hostfile $PBS_NODEFILE /public/home/ms/Accelrys/MaterialsStudio44/bin/castepexe_mpi.exe "$project_name"_Optics

只要qsub 就被杀死！！！   没有什么错误提示，这是MS任务。。。。。具体我不懂!!!,求大神解惑。。。。。。。。。。给位虫友帮忙，当然也希望能给偶其他【就算光学，声子pbs脚本思路】！！！
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1楼 2012-11-12 10:01:21
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pengliusss

木虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by digghost at 2012-11-13 23:58:59
有可能是版本不对，你的版本比服务器的高

开始时，是高，改过了。。。
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8楼2012-11-14 14:34:09
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pengliusss

木虫 (小有名气)
错误提示：：：
Checked out license feature: MS_castep_site [for Unavailable] (16 copies)

MPI Application rank 0 exited before MPI_Finalize() with status 1
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2楼2012-11-12 10:12:25
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pengliusss

木虫 (小有名气)
Error: ion_atom_inquire_usp: file "S_00PBE.usp" not found
Current trace stack:
ion_atom_inquire_usp
ion_read
castep
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3楼2012-11-12 10:14:08
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pengliusss

木虫 (小有名气)
HP-MPI licensed for Accelrys.

Checked out license feature: MS_castep_site [for Unavailable] (8 copies)
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4楼2012-11-12 11:21:22
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