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seamas_gao1

银虫 (小有名气)

[求助] 请问在测序反应中某个碱基出现套峰,是否说明该等位基因是杂合子呢?

请问在测序反应中某个碱基出现套峰,是否说明该等位基因是杂合子呢?
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竹子小小

木虫 (小有名气)

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★ ★
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seamas_gao1: 金币+2, ★★★很有帮助, 十分感谢! 2012-11-13 16:32:25
套峰?我只知道那代表测序没测好吧。你测了几次?每次都一样吗。什么是杂合子。你拿什么去测的
2楼2012-11-09 10:32:50
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seamas_gao1

银虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 竹子小小 at 2012-11-09 10:32:50
套峰?我只知道那代表测序没测好吧。你测了几次?每次都一样吗。什么是杂合子。你拿什么去测的

在特定一个碱基上,测了三次,每次都有套峰。杂合子就是说等位基因在这个碱基的位置上是存在SNP的,所以会产生套峰。是不是这样呢?
3楼2012-11-10 12:38:17
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hongqifei

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
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seamas_gao1: 金币+4, ★★★很有帮助, 十分感谢! 2012-11-13 16:32:48
如果只在某个碱基处有套峰,其他地方都没有杂峰,那基本上就是杂合的。用反向引物再测一次,结果更准确。
何须剑道争锋?千人指,万人封,可问江湖鼎峰,三尺秋水尘不染,天下无双。
4楼2012-11-10 13:47:16
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gaoyang636

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
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小丹木木: 金币+2, 鼓励交流 2012-11-10 15:39:35
seamas_gao1: 金币+4, ★★★★★最佳答案, 十分感谢! 2012-11-13 16:32:55
那请问你是送的啥去测序?
常用的方法1:pcr产物纯化->回收连质粒->转化摇菌->平板挑单克隆->单克隆培养并PCR验证->送菌液;
方法2:PCR产物纯化->回收测浓度->送测序。
方法1的话,即便是杂合子也测不出来套峰……方法2的话,倒是有可能出套峰。
这个位置前后都一致么?是否双向测序呢?位置附近的峰图正常好看不?最好贴一下。
5楼2012-11-10 14:44:05
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seamas_gao1

银虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by gaoyang636 at 2012-11-10 14:44:05
那请问你是送的啥去测序?
常用的方法1:pcr产物纯化->回收连质粒->转化摇菌->平板挑单克隆->单克隆培养并PCR验证->送菌液;
方法2:PCR产物纯化->回收测浓度->送测序。
方法1的话,即便是 ...

是用方法2做的,前后位置一致,是双向测的,周转的峰图很正常,人在外面图不好发,等回去再发~
6楼2012-11-11 08:56:30
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