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米亚

金虫 (正式写手)

[求助] 晶体完成度低,怎么办!文章急用,请高手支招

之前的一个铜配合物精修后R1值在0.1以下,就没管,最近投文章要用,check后发现完成度低,该怎么办啊?
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cluster8676

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
lijunjie84: 金币+1, 说的很清楚了!呵呵,辛苦了! 2012-11-12 13:30:22
lijunjie84: 回帖置顶 2012-11-12 13:30:29
米亚: 金币+2, 有帮助, 谢谢啦 2012-11-12 13:41:36
引用回帖:
8楼: Originally posted by 米亚 at 2012-11-11 19:25:19
请问您能不能给我具体讲一下我这个晶体该如何处理啊,我问了周围会解晶体的,他们都说不明白!麻烦了,...

我简单点说你可能可以明白.在做吸收校正的时候,也就是SADABS.选LAUE group的时候默认的是选项2,也就是Monoclinic, 2/m, 这样的话由于有个C2轴的存在吸收校正就只用到了你的一半左右的数据.所以完整度一般不超过70%. 如果完整度在80%-95%之间的话,就不是这个问题了.

所以重做吸收校正的时候选择1,triclinic,这样的话你的所有数据都会被用到.完整度自然就上去了.

我现在习惯了不管什么空间群都选1,这样就不会有完整度问题了.也不会影响精修.

不知道说明白了么.
学无止境
10楼2012-11-12 13:28:03
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lsccoffee

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
米亚: 金币+1, 有帮助 2012-11-10 09:50:18
linhua0402313: 金币+1, 感谢回帖交流,欢迎常来晶体板块 2012-11-12 08:58:56
omit -3 50 试试 可能会提高完成度
3楼2012-11-09 20:30:34
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普通回帖

huahua1216

至尊木虫 (文坛精英)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
liuxiaocunde: 金币+1, 感谢交流 2012-11-09 12:14:19
米亚: 金币+2, 有帮助, 谢谢,请问,你的意思是说我这个是三斜晶系的,但是收数据的时候是按高对称性收集的吗??????? 2012-11-09 13:03:03
1 给别人数据要ins 和 hkl 其他没用
2 你这个数据应该是按照单斜或者更高对称性收集的 完整度严重不够 应该发布出去 重测吧
2楼2012-11-09 10:28:22
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cluster8676

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
米亚: 金币+5, 有帮助, 谢谢,我想问您所说的吸收校正是还原晶体的时候吗?还是解晶体的时候,我们实验室不做晶体所以这方面不懂,请指教 2012-11-10 09:52:28
linhua0402313: 金币+1, 感谢回帖交流,欢迎常来晶体板块 2012-11-12 08:59:02
lijunjie84: 专家考核 2012-11-12 13:28:47
你这个问题显然不是用OMIT命令就能解决的。完整度低可能是你收数据的时候收的是半球,如果你收的是全球的话,重做吸收校正的时候选laue group的时候选1,就行了。
学无止境
4楼2012-11-09 22:48:32
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cluster8676

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
米亚: 金币+1, 有帮助, 我们的晶体是拿到测试中心给测得,最后只给一个数据,不知道他怎么收的数据怎还原的,这个晶体除了完整度不够外,晶胞参数里有两个角大于90度,有点怪异 2012-11-10 14:59:11
linhua0402313: 金币+1, 感谢回帖交流,欢迎常来晶体板块 2012-11-12 08:59:13
linhua0402313: 专家考核 2012-11-12 08:59:18
首先你要知道你的晶体收的是全球的还是半球的.吸收校正是还原完数据之后做的.我用的是SAINT+软件,不知道你们用的什么?
学无止境
5楼2012-11-10 11:00:10
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xmuamoy

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
引用回帖:
4楼: Originally posted by cluster8676 at 2012-11-09 22:48:32
你这个问题显然不是用OMIT命令就能解决的。完整度低可能是你收数据的时候收的是半球,如果你收的是全球的话,重做吸收校正的时候选laue group的时候选1,就行了。


你的方式确实很有用。我有一套数据,收的全球,2theta收到了56度,居然完整度不够。加ACTA 50, 完整度还达不到95。采用你的方法,Acta 53时,完整度可达98意思。我猜想是Shelxs程序算法有问题。
6楼2012-11-10 22:12:48
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cluster8676

至尊木虫 (著名写手)

引用回帖:
6楼: Originally posted by xmuamoy at 2012-11-10 09:12:48

你的方式确实很有用。我有一套数据,收的全球,2theta收到了56度,居然完整度不够。加ACTA 50, 完整度还达不到95。采用你的方法,Acta 53时,完整度可达98意思。我猜想是Sh ...

有帮助就好.
学无止境
7楼2012-11-11 03:11:23
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米亚

金虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by cluster8676 at 2012-11-09 22:48:32
你这个问题显然不是用OMIT命令就能解决的。完整度低可能是你收数据的时候收的是半球,如果你收的是全球的话,重做吸收校正的时候选laue group的时候选1,就行了。

请问您能不能给我具体讲一下我这个晶体该如何处理啊,我问了周围会解晶体的,他们都说不明白!麻烦了,
给我你的爱,我们一起去看地老天荒
8楼2012-11-12 08:25:19
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xmuamoy

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖


lijunjie84: 金币+1, 感谢分享!!! 2012-11-12 13:29:32
cluster8676讲的非常清楚,我正好碰到类似情况,验证后很有效。“如果你收的是全球的话,重做吸收校正的时候选laue group的时候选1,就行了。”,指的是做吸收校正时选空间群为P1,不是P-1,这样的话衍射点hkl与-h-k-l不会进行合并。我猜想:如有1000个衍射点,丢失了100个,此时完整率只有90,如数据不合并,那么你会有2000个衍射点,此时丢失了100个,那么完整率为95%,这纯粹只是推测。但有一点可以肯定,目前计算完整率的方法存在一些缺陷。
9楼2012-11-12 12:06:03
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