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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 存档旧帖 » 求助基因芯片表达谱推测通路
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janelnnq

铁虫 (初入文坛)

[求助] 求助基因芯片表达谱推测通路

我研究的是材料与正常巨噬细胞相互作用的作用情况，我的材料经过修饰后不会被细胞吞噬（修饰前会被吞），但很奇怪的是，细胞在与材料作用之后，反而较未修饰前分泌了更多的细胞因子。
我们思前想后找不出原因，因此老板让我做了一个表达谱基因芯片，想看一看作用后细胞的信号通路是不是发生了一些变化。最近一直在分析结果，本人不是不是做分子生物的，查了很多文献，但还是整不出一个头绪来，求哪位高手能帮忙一下啊！！
上网查阅有关信号通路的无非是GPCR，integrin等，我的这部分相关基因表达蛋白有些是上升的，但很奇怪的是，到下游之后，ras，PKC等重要的基因都下调了，我百思不得其解啊，求高手！！！！！
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1楼 2012-11-07 10:58:04
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dufei1112

金虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

可用用差异mRNA做GO 和KEGG分析
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科研技术服务整体解决方案
2楼2013-04-23 01:13:35
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nlbtr

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

首先，你的“分泌很多细胞因子”的结论是怎么得来的？
如果分泌了，说明本身这些基因在你材料的作用下高表达了。
那么你要确认，这些因子与吞噬作用是不是正相关的？也就是，吞噬作用是需要这些因子介导的。是的话，那就是正常现象。不是的话，你要考虑你材料本身对细胞的作用了。
永远记得，芯片知识辅助的作用，而不是你需找通路的手段。而且芯片假阳性会很多。
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3楼2013-04-23 09:02:03
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