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fearless_

木虫 (正式写手)

[交流] 位置较远突变对酶的影响？

最近在做酶的理性改造，发现一个离活性位点较远的残基对酶的活性影响较大，请问有哪几种原因？
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1楼 2012-11-04 22:05:31
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hzlatqh

银虫 (小有名气)
★ ★
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fearless_: 回帖置顶 2012-11-05 20:14:37
fearless_: 金币+1, 能否介绍几篇文献？实在不太好找 2012-11-05 20:18:55
引用回帖:
3楼: Originally posted by fearless_ at 2012-11-05 11:23:04
是前者，通过同源建模看出来的，但是请问离得比较远，突变一个残基是怎样影响到底物结合口袋，有什么方法证明？最好有相似的文献可以参考，谢谢！...

可以看看 anping zeng的文章，他有一些工作就是关于这方面的
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4楼2012-11-05 13:14:18
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joan198108

铁杆木虫 (正式写手)
★ ★ ★ ★ ★
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fearless_: 金币+2 2012-11-05 11:23:17
小丹木木: 金币+2, 鼓励交流 2012-11-06 17:26:32
不知都楼主说的离活性为中心远是从晶体结构还是从氨基酸序列上看的，前者比较有说服力，后者的话就难说了，肽链的折叠很复杂的。一般影响较大的就是整个蛋白的构象以及电子分布情况吧。前者可能会影响活性位点的结构，最常见的就是底物结合口袋。后者影响较大的可能是通过离子键等形式结合的底物等等。
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2楼2012-11-05 10:34:12
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fearless_

木虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by joan198108 at 2012-11-05 10:34:12
不知都楼主说的离活性为中心远是从晶体结构还是从氨基酸序列上看的，前者比较有说服力，后者的话就难说了，肽链的折叠很复杂的。一般影响较大的就是整个蛋白的构象以及电子分布情况吧。前者可能会影响活性位点的结构 ...

是前者，通过同源建模看出来的，但是请问离得比较远，突变一个残基是怎样影响到底物结合口袋，有什么方法证明？最好有相似的文献可以参考，谢谢！
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3楼2012-11-05 11:23:04
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joan198108

铁杆木虫 (正式写手)
★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
fearless_: 金币+1 2012-11-05 20:14:32
引用回帖:
3楼: Originally posted by fearless_ at 2012-11-05 11:23:04
是前者，通过同源建模看出来的，但是请问离得比较远，突变一个残基是怎样影响到底物结合口袋，有什么方法证明？最好有相似的文献可以参考，谢谢！...

只是猜测，证明方法也只能是同源建模吧，晶体衍射就太复杂了
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5楼2012-11-05 14:36:22
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hzlatqh

银虫 (小有名气)
★ ★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
fearless_: 金币+4, tks 2012-11-06 23:17:43
引用回帖:
4楼: Originally posted by hzlatqh at 2012-11-05 13:14:18
可以看看 anping zeng的文章，他有一些工作就是关于这方面的...

希望下面2篇文献能帮到你：
Science. 2008 Oct 17;322(5900):438-42.
Appl Environ Microbiol. 2011 Jul;77(13):4352-60.
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6楼2012-11-06 13:41:30
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alarace

至尊木虫 (知名作家)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
4楼: Originally posted by hzlatqh at 2012-11-05 13:14:18
可以看看 anping zeng的文章，他有一些工作就是关于这方面的...

劳驾把anping zeng的相关文章题目贴一下吧，谢谢！
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7楼2012-11-06 14:37:42
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hzlatqh

银虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
7楼: Originally posted by alarace at 2012-11-06 14:37:42
劳驾把anping zeng的相关文章题目贴一下吧，谢谢！...

Appl Environ Microbiol. 2011 Jul;77(13):4352-60
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8楼2012-11-06 15:58:31
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alarace

至尊木虫 (知名作家)
引用回帖:
8楼: Originally posted by hzlatqh at 2012-11-06 15:58:31
Appl Environ Microbiol. 2011 Jul;77(13):4352-60...

谢谢！
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9楼2012-11-06 20:08:51
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