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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 细菌真菌鉴定方法及手册 基因序列查询网站
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yuanguodong1212

银虫 (小有名气)

[交流] 细菌真菌鉴定方法及手册 基因序列查询网站

昨天见有人求助细菌鉴定方面的知识，我有些感触，于是搜集了一些 细菌真菌鉴定方面的材料，希望对菌种选育，菌种筛选的同志们有一点点帮助。
     我是新虫，第一次发贴，有做的不妥的地方 还请大家斧正。
     
细菌鉴定
   具体 鉴定方法 见附件。
   微生物菌种鉴定（Identification of Bacteria）是微生物分类学（ classification of microorganism）的一个部分。人们在进行微生物工作时，往往要求知道工作菌株的名称，菌种鉴定就是将自己所欲鉴定菌株的主要特征与合适的检定手册中所列的各种菌的特征相对照，以便在较短时间内能找出该菌的名称。各类微生物的特性不一，各有不同的检定系统，但工作方法基本相同。这里以细菌鉴定为例介绍细菌鉴定的基本程序和常用的鉴定手册。
       鉴定步骤可按下列程序进行：（1）根据鉴定对象，选用合适的分类系统和工作用的检索表；（2）所用菌株必须绝对纯洁；（3）仔细阅读检索表的内容，选择鉴定时所需的试验方法；（4）按照正确的操作，将试验结果详细记录，并逐条与检索表的内容查照。一般情况下，可以比较容易地查出所鉴定的未知菌株的属（Genus）名，如希望定出种（Specis）名，就应当进一步找出正式的菌种鉴定分类的专著中所列菌种名称。
目前国际上最负盛名的细菌分类鉴定系统是《伯杰氏细菌鉴定手册》（Bergey's manual of Determinative Bacteriology），这本书自 1923年刊出第一版后，到 1994年已出第九版。书中对细菌的划分并不强调在进化中的相互关系，而目的在提供为细菌鉴定用的系统，是依据形态，鉴别染色反应，细胞壁化学成分，对氧的需求以及生理生化特性而编排。由于分子遗传学的技术应用到细菌学分类，例如细菌的碱基比值（G+ C％），核酸杂交（DNA-DNA，DNA-RNA）；特别是16S rRNA 序列的比较研究，对微生物之间的关系和进化途径有了比较深入的认识，1984年《伯杰氏系统细菌学手册》（Bergeys' Manual of Systematic Bacteriology）第一版问世，在细菌分类的系统中也反映出细菌进化的关系，认为古细菌与真细菌虽然表型相似，但就细胞成分及16S rRNA 序列的比较，在生物进化树上处于不同的分枝。所有真核生物包括原生动物、真菌、动物和植物则又是另一分枝。这就是在Woese研究16S rRNA 序列的基础上，提出的生物三原界（Prokingdom）学说，即古细菌原界、真细菌原界和真核生物原界。
查询DNA序列  可以用 ncbi的开放数据库 GENBANK  网址为 ：http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Genbank/GenbankSearch.html

真菌鉴定我就不多罗嗦了！  真菌鉴定手册在gbaopan 里  有15M左右 是超星电子书格式，大家没有超星图书浏览器的  去网上下一个就ok了
手册网址是  http://yuanguodong1212.gbaopan.com/MyFiles.aspx

[ Last edited by johnsooh on 2007-6-25 at 10:41 ]
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1楼 2007-06-24 15:25:34
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yuanguodong1212

银虫 (小有名气)
另外 我发时忘了点提供资源给大家  如果方便的话  请斑竹帮忙改一下。
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2楼2007-06-24 15:52:11
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郝敬喆

新虫 (小有名气)
现在正作植物细菌鉴定，谢谢给与帮助。
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3楼2007-06-24 22:16:56
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