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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 请教高斯计算中化学键出现断键和成新键的问题
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fullerenec60

铜虫 (小有名气)

[求助] 请教高斯计算中化学键出现断键和成新键的问题

请教高手，刚刚开始学习计算，为什么我在高斯基态结构优化中会出现结构中的化学键断键情况呢？同时也有形成新化学键的情况呢？明明画好的分子，优化后不是我需要的分子了，这是什么情况啊？非常感谢高手能来指教。.金币不多，旨在交流
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fullerenec60

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1楼 2012-10-16 07:50:42
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

lxhlxh052c

木虫 (著名写手)

小木虫之无虫

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
fullerenec60: 金币+1, ★★★很有帮助 2012-10-16 11:56:06
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=3201640
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这就是我想要的
2楼2012-10-16 10:47:54
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fullerenec60

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
9楼: Originally posted by 喻儿在线 at 2012-10-23 21:58:46
这个应该没有直接的方法可以做，要不就只能用固定键长进行优化了，可是在亚稳态状态下进行的优化，你不做任何处理而要得到收敛是比较困难的。除此之外，你优化后的结构在GaussView中打开显示某处没有键，并不代表这 ...

真的会出现各种各样的问题啊，单键变成了双键，双键变成了单键，但是chk文件中显示却没问题。请问一下一般都用GassianView画分子吗，用ChemDraw画的好像有问题，无缘无故出现好多键。还有利用优化好的结构的out文件计算吸收光谱，直接GassianView打开文件进行运算对不对？谢谢
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10楼2012-10-24 19:46:47
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普通回帖

fullerenec60

铜虫 (小有名气)
送鲜花一朵
多谢，我去学习一下，原来这个是很初级的问题呢
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3楼2012-10-16 11:53:25
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求学之子

新虫 (小有名气)
我们初始画的构型都是自己的设想，优化出来的可能与自己想的不一样是很正常的，刚开始我们的构型要更合理，比如说键长之类的不要太长，还有一个很重要的认识：我们用软件打开优化好的文件有时候不显示成键，只是原子间的距离与程序设定的值有差别，不代表它们没有成键（当然原子的距离太长了也自然没有成键了）
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4楼2012-10-16 12:09:34
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dukelr

金虫 (小有名气)
典型的新手呀，先泡BBS再说 呵呵
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5楼2012-10-16 16:06:22
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fullerenec60

铜虫 (小有名气)
多谢多谢，学习中...
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6楼2012-10-17 07:50:14
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喻儿在线

金虫 (小有名气)

很不愿意努力但必须努力的大喵
如果你想知道断键处是否存在键，可以用AIM2000计算两个分子之间临界点，如果此处的拉普拉斯值为负，则此处的键仍是共价键，这只用于大概的判断
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fullerenec60
一旦开始就不要害怕！
7楼2012-10-20 12:38:20
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fullerenec60

铜虫 (小有名气)
送鲜花一朵
引用回帖:
7楼: Originally posted by 喻儿在线 at 2012-10-20 12:38:20
如果你想知道断键处是否存在键，可以用AIM2000计算两个分子之间临界点，如果此处的拉普拉斯值为负，则此处的键仍是共价键，这只用于大概的判断

谢谢，不是专业的计算，只要计算结果中保证化学键不被随便断开或成键就满意了
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8楼2012-10-22 12:58:52
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喻儿在线

金虫 (小有名气)

很不愿意努力但必须努力的大喵
这个应该没有直接的方法可以做，要不就只能用固定键长进行优化了，可是在亚稳态状态下进行的优化，你不做任何处理而要得到收敛是比较困难的。除此之外，你优化后的结构在GaussView中打开显示某处没有键，并不代表这里断键了，有的时候双键优化后会变成单键，这也是可能出现的情况。我之前介绍的那个软件可以比较快的得到这个信息，计算时间不会超过一个小时，你可以去看看
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一旦开始就不要害怕！
9楼2012-10-23 21:58:46
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