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minmin_0082003金虫 (正式写手)
莫愁莫愁
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[求助]
求助两个问题，一个是siesta如何固定键长以及高对称性分子的建模
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1 siesta固定键长，显然不能固定原子的坐标，这样的话这两个原子不会被优化，如果要做精确键长与能量的变化关系会不准确。 当然可以考虑使用z-matrix。但是问题在于z-matrix是要坐标从0.0 0.0 0.0 开始的。所以当我的表面笛卡尔坐标不是从原点开始的时，再转化到z-matrix坐标时，连坐标轴也会变化。导致连cell也要改。但是要改cell貌似有点麻烦。请问还有其他简便办法吗 2 想建造一个Ih对称性的将近200个原子金属簇，但是没有现成的坐标。对于建立小的金属簇还能行，这么大的该怎么建立呢。 请各位大虾们指教 |
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