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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » vesta的bug貌似还不少呢
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Prettyswan

木虫 (小有名气)

[交流] vesta的bug貌似还不少呢 已有4人参与

同样的结构CONTCAR，用vesta打开是一种

用xcrysden打开则是另一种

在此之前，我曾经用vesta打开MS的.cell文件，结构发生了“畸变”，但是从.cell文件中直接复制晶格基矢和点阵位置坐标做成POSCAR，放到vesta中就是正确的。

[ Last edited by Prettyswan on 2012-9-5 at 17:37 ]
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1楼 2012-09-05 17:34:50
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

huangll99

木虫 (职业作家)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
vesta的bug？ 还是楼主的想法有bug?
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2楼2012-09-05 17:44:16
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huangll99

木虫 (职业作家)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
9楼: Originally posted by Prettyswan at 2012-09-08 11:14:17
键长和键角是怎么回事？
我感觉会不会是vesta不支持cartesian坐标导致的？
还有一点就是，我用ms做的Cu（111）的表面，导出结构为.cell文件，直接打开的话就不再是六角了，但是直接复制其中的晶格参数和点阵位置 ...

vesta确实不支持cartesian坐标
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10楼2012-09-08 11:30:47
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普通回帖

chenxin1992

银虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
看的角度不一样，VESTA的键不自动显示
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3楼2012-09-05 22:13:09
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Prettyswan

木虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by chenxin1992 at 2012-09-05 22:13:09
看的角度不一样，VESTA的键不自动显示

这是对Cu（100）面内吸附NH2的结构，我对键长和键角的截图
键角：
键长1：
键长2：
这货还是NH2吗？
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4楼2012-09-06 08:47:37
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Prettyswan

木虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by huangll99 at 2012-09-05 17:44:16
vesta的bug？ 还是楼主的想法有bug?

这是对Cu（100）面内吸附NH2的结构，我对键长和键角的截图
键角，phi(H2-N1-H1) =  38.9211(0) deg：
键长1，l(N1-H1) =  5.18875(0) Å：

键长2，l(N1-H2) =  4.86496(0) Å：

这货还是NH2吗？
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5楼2012-09-06 08:51:38
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calos818

木虫 (著名写手)

新人菜鸟
引用回帖:
2楼: Originally posted by huangll99 at 2012-09-05 17:44:16
vesta的bug？ 还是楼主的想法有bug?

正解
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6楼2012-09-06 09:47:20
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Prettyswan

木虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by calos818 at 2012-09-06 09:47:20
正解...

求大神解释解释上面的键角和键长是怎么回事？
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7楼2012-09-06 16:28:50
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aaq2800

铁杆木虫 (知名作家)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
我怎么看着这2个结构是一样的呢，视角不同而已
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8楼2012-09-08 08:20:30
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Prettyswan

木虫 (小有名气)
引用回帖:
8楼: Originally posted by aaq2800 at 2012-09-08 08:20:30
我怎么看着这2个结构是一样的呢，视角不同而已

键长和键角是怎么回事？
我感觉会不会是vesta不支持cartesian坐标导致的？
还有一点就是，我用ms做的Cu（111）的表面，导出结构为.cell文件，直接打开的话就不再是六角了，但是直接复制其中的晶格参数和点阵位置坐标做成POSCAR就是正确的。之前因为不了解这一点，还让老师给点评了呢。
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9楼2012-09-08 11:14:17
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