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phbgp

铁虫 (小有名气)

[求助] NBO分析

我是新手,想请问一下NBO分析中,一个含苯环的化学物,如果要计算苯环的电子数变化和电荷转移,是不是把苯环上的六个碳原子的电子数加起来和未变化之前的电子数比较呢?谢谢
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lishijunzong

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
应该还要分析氢,就是把一部分作为整体,进行分析
3楼2012-09-03 09:36:23
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查看全部 8 个回答

phbgp

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by sobereva at 2012-09-03 01:08:36
可以这么比较

谢谢你的回复哦,我还想问一下如果比较两个分子的电荷数,比如NBO分析后(加了溶剂模型)一个分子的电荷数是0.0083.另一个是0.00001,可以说明前一个分子和和吸附剂形成的静电作用强吗?电荷数可以说明什么问题呢?
4楼2012-09-03 15:45:17
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wang_dan1990

木虫 (小有名气)

风筝

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gmy1990: 金币+2 2012-09-03 19:41:37
“我还想问一下如果比较两个分子的电荷数,比如NBO分析后(加了溶剂模型)一个分子的电荷数是0.0083.另一个是0.00001,可以说明前一个分子和和吸附剂形成的静电作用强吗?电荷数可以说明什么问题呢?”一个分子,它的电荷数不应该是0吗?如果想比较和吸附剂形成的静电作用,我建议,分别做这两个分子使用溶剂和不使用溶剂的NBO分析,然后将使用溶剂和不使用的电荷数的差值进行比较。差值大,说明静电力强。
5楼2012-09-03 16:31:16
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sobereva

至尊木虫 (著名写手)

本人已永久离开小木虫


【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gmy1990: 金币+3 2012-09-03 19:41:42
不能这么说明静电作用强弱。
如果你用的是隐式溶剂模型(PCM等),分子总电荷数的差异属于数值精度问题,没有物理意义。对于中性分子,精确结果都应当为0。
就算用的是显式溶剂模型,靠分子整体的净电荷也几乎没法直接和静电相互作用强度联系起来。最粗糙的表示静电相互作用强弱的方法是用原子电荷根据库仑定律来算分子间静电作用能。
如果想更精确一些描述这个问题,可以做能量分解,比较其中静电部分能量大小。
6楼2012-09-03 19:12:57
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