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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 程序语言 » 其它 » 并行计算没有输出？怎么回事
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田山东

捐助贵宾 (著名写手)

[求助] 并行计算没有输出？怎么回事

家好。感谢论坛上的各位好友对我的帮助。

昨天并行运算弄好了，速度确实快了很多，以前要30小时算完的程序，现在10小时左右就可以了。但是计算完成之后，我发现输出文件没有数据。这是怎么回事呢？

串行 计算的时候我都是把输出输出到一个文件下，改成并行计算了，语句没有修改，是不是并行情况下要对输出语句修改一下啊？

  

谢谢！
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everythinghasitsseason.enjoyyourlife.
1楼 2012-08-28 08:13:43
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田山东

捐助贵宾 (著名写手)
引用回帖:
14楼: Originally posted by libralibra at 2012-08-31 18:22:53
MPI并行的大框架就是

读数据
分发数据 (前面2不不是必须,也可以根据core id号去读取自己需要的那部分数据,反正就是每个core只拿到自己运算需要的数据)
然后运算(如果运算过程有不能并行的部分,需要gather到一 ...

我发现我的问题是这样的：串行运行的时候，单个程序会产生一个很大的数组，大约60G，服务器总内存只有120G，所以一个程序产生的数组占内存占到了49%左右，我这个服务器最多只能运行两个程序。并行运算之后，比如我分配6个节点，我会发现很快每个节点占内存达到20%多，很奇怪，这样的话加在一起总数据量比原来大很多啊。
是你说的这个原因吗？是数据分配不合理的事吗？
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everythinghasitsseason.enjoyyourlife.
15楼2012-09-01 21:20:49
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libralibra

至尊木虫 (著名写手)

骠骑将军

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
田山东: 金币+5, ★★★很有帮助, 谢谢你了。我再摸索下 2012-08-28 17:01:33
并行之前将数据broadcast到每个core,分别计算
你要写文件之前,需要将数据重新collect到同一个core来写文件,因为每个core的运算不可能同时结束,所以需要synchronization
如果涉及文件读写,基本框架是:

master读文件
broadcast/划分数据给children
所有children并行运算
collect数据到master(同步)
master写文件
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matlab/VB/python/c++/Java写程序请发QQ邮件:790404545@qq.com
2楼2012-08-28 15:36:16
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田山东

捐助贵宾 (著名写手)
很奇怪啊，一个小的体系就能把结果输出到文件中，大的体系反而不行了呢。我按照你给我的思路再摸索下。谢谢了
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everythinghasitsseason.enjoyyourlife.
3楼2012-08-28 17:02:31
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田山东

捐助贵宾 (著名写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by libralibra at 2012-08-28 15:36:16
并行之前将数据broadcast到每个core,分别计算
你要写文件之前,需要将数据重新collect到同一个core来写文件,因为每个core的运算不可能同时结束,所以需要synchronization
如果涉及文件读写,基本框架是:

master读 ...

可以给个实例吗？或者推荐一本书也行啊、谢谢
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everythinghasitsseason.enjoyyourlife.
4楼2012-08-28 17:03:17
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