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fyuewen

金虫 (正式写手)

[交流] 虚晶近似方法得到的赝势怎么用？如何修改相应的in文件中的原子位置和原子种类？

最近我用虚晶赝势方法生成了一个N和O的混合赝势（比如叫做new.pbe.UPF)，混合比例1:9现在想利用这个赝势计算我之前算过的某体系的band，DOS等。但是问题是输入文件的原子位置，种类等这个地方不知道怎么写笔记恰当。
我的in文件里面原先的数据中包含部分以下内容
ATOMIC_SPECIES
##  #####  ####.UPF     （我用#代替了一些信息）
##  #####  ####.UPF
O  15.9994  O.pbe-van_ak.UPF          这一行，我应该用什么原子来替代呢？

ATOMIC_POSITIONS {crystal}
#       0.000000000   0.000000000   0.0
#       0.500000000   0.500000000   0.5
O        0.500000000   0.000000000   0.5     氧原子的位置也要被虚拟原子代替，如何改？
O        0.000000000   0.500000000   0.5
O        0.500000000   0.500000000   0.0

我想这几个关键地方改好了，之后的计算就可以了。希望高手解答。谢谢

[ Last edited by fyuewen on 2012-8-25 at 10:03 ]
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1楼 2012-08-24 16:49:07
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fyuewen

金虫 (正式写手)
★ ★
franch: 金币+2, 鼓励交流。。 2014-05-05 22:51:35
引用回帖:
5楼: Originally posted by jfgood at 2014-04-29 22:03:55
问楼主：虚晶赝势方法生成了一个N和O的混合赝势，这个是怎么实现的呢？是用fhi98PP么？里边的各个量子数怎么设定？

N-O混合，需要使用pwscf里的工具。很久没做这方面工作了。有时间再看看。
fhi98pp这个我没有用过。
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6楼2014-04-30 09:26:55
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souledge

专家顾问 (著名写手)
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
fyuewen: 金币+10, 谢谢souledge，我明天根据您的建议试一下。谢谢您的指导。 2012-08-26 23:27:16
xueht987: 金币+1, 鼓励交流！ 2012-08-27 09:50:34
程序在意的只有赝势中的势，而不在意你给它取个啥名字。只要species中定义的跟position中的对应就OK。
赝势文件中的元素名只在+U计算中用到。
元素原子量则是在分子动力学和声子频率计算中用到。
混合后的赝势容易出现各种计算错误，最典型的是对角化失败，这对赝势质量及两赝势的生成方法要求很多。所以如果没有同作者生成的，最好还是自己生成。
顺便，N和O的化学差别比较大，不敢说这么搞靠不靠谱。至少Vanderbilt建议只用VCA于同族的元素之间。
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2楼2012-08-26 00:46:57
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fyuewen

金虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by souledge at 2012-08-26 00:46:57
程序在意的只有赝势中的势，而不在意你给它取个啥名字。只要species中定义的跟position中的对应就OK。
赝势文件中的元素名只在+U计算中用到。
元素原子量则是在分子动力学和声子频率计算中用到。
混合后的赝势容 ...

in文件里面的ATOMIC_SPECIES这个地方：
O  15.9994  O.pbe-van_ak.UPF
应该换成哪个原子量呢？
我是按照N:O=1:9这个赝势混合比来写这个原子量吗？我试过15.7979
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3楼2012-08-26 23:32:10
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jfgood

木虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
问楼主：虚晶赝势方法生成了一个N和O的混合赝势，这个是怎么实现的呢？是用fhi98PP么？里边的各个量子数怎么设定？
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5楼2014-04-29 22:03:55
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