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心星之xin

铜虫 (初入文坛)

[求助] 使用plantcare预测启动子区域的结果如何看如何分析已有7人参与

如题,我将一个基因的ATG前1500bp左右的片段截下来后,放到plantcare上进行分析,出现下面的结果,请各位大侠帮忙解释一下怎么看这个结果,怎么分析,有预测出启动子区域吗?
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cfind

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

不知道现在回复还有没有用,我用的google浏览器,可以点开,挺好用的。我觉得这个软件只是简单地分析你提交的序列中的顺式作用元件,不能确定启动子的5'端,目前好像也没有软件能确切预测启动子的大小,除非克隆启动子,看功能的完整性
like it or lump it!
17楼2014-08-20 16:34:28
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查看全部 19 个回答

心星之xin

铜虫 (初入文坛)

肿么没有人回复呢,期待啊
2楼2012-08-20 16:26:04
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zhqu1234

银虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
序列下面有tata-box和caat-box的预测,你按加号点开就行了。
3楼2012-08-20 16:35:04
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wjzpwyz

铁虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
amisking: 金币+1, 鼓励发帖交流问题。 2012-08-20 22:14:27
TATA、CAAT-box等特定的DNA序列通常在启动子前-700bp到+300bp(这个有的文献说法不一致,有的是-300bp到0bp)出现,其余那些都有在启动子之前一定范围出现,要查文献才能确定
4楼2012-08-20 17:45:20
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