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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » MS建设石墨烯纳米带为什么周期性没有了？
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aaq2800

铁杆木虫 (知名作家)

[求助] MS建设石墨烯纳米带为什么周期性没有了？

第一图是建立的石墨石墨烯，第二图是裁剪想得到扶手椅型纳米带，周期是x方向，可是几个C原子的外延的键没有了，就是说如果加H的话，x方向这几这个C原子都能加上H，明显不是周期性的了
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1楼 2012-08-13 09:59:36
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aaq2800

铁杆木虫 (知名作家)
无人回答，俺自己顶一下
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2楼2012-08-13 19:06:08
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xujc1983

木虫 (著名写手)

苦逼青椒一枚

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
xueht987: 金币+2, 鼓励交流！ 2012-08-14 00:15:05
aaq2800: 金币+20, ★★★很有帮助, 2 2012-08-14 08:09:56
不好意思，没做过石墨烯方向，楼主是想建立这样的石墨烯吗？
通过build，symmetry，redefine lattice可以实现这样的转变。
不管怎么变都是重复单元，无非有大有小，在redefine lattice中可将原来的某个晶格矢量改变一下，相对于原来的A （1 0 0）的晶格矢量，更改后新的A相当于原坐标系下的（2 1 0），所以将A的晶格矢量改为（2 1 0）即可得到第一幅图中的结构

椅式石墨烯



redefine lattice
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3楼2012-08-13 22:07:11
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xujc1983

木虫 (著名写手)

苦逼青椒一枚
引用回帖:
3楼: Originally posted by xujc1983 at 2012-08-13 22:07:11
不好意思，没做过石墨烯方向，楼主是想建立这样的石墨烯吗？
通过build，symmetry，redefine lattice可以实现这样的转变。
不管怎么变都是重复单元，无非有大有小，在redefine lattice中可将原来的某个晶格矢量改 ...

说明下第二幅图，是针对120夹角的石墨烯进行Redefine Lattice，得到的第一幅图中的结构。为了方便说明基矢的选择，将两个结构放到了一起，为第二幅图中的结构。
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4楼2012-08-13 22:12:01
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liuyf1110

铜虫 (小有名气)
路过学习，不过俺们以前的经验这种大超胞，里面的原子不再是严格的平移对称的。
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5楼2012-08-13 22:25:19
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xujc1983

木虫 (著名写手)

苦逼青椒一枚
引用回帖:
5楼: Originally posted by liuyf1110 at 2012-08-13 22:25:19
路过学习，不过俺们以前的经验这种大超胞，里面的原子不再是严格的平移对称的。

理由呢？说实话，我很怀疑你的这个经验。如果不是平移对称，那晶格有什么用呢？
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6楼2012-08-14 00:44:38
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liuyf1110

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
引用回帖:
6楼: Originally posted by xujc1983 at 2012-08-14 00:44:38
理由呢？说实话，我很怀疑你的这个经验。如果不是平移对称，那晶格有什么用呢？...

理由就是我做的计算结果啊，曾经算过碳管不同长度的超胞结构优化，由多个小超胞组成的一个大超胞进行优化后，大超胞内的原来的小超胞部分不再是原来的严格周期平移对称，当然变化很小。您也可以算一下试试看嘛。
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7楼2012-08-14 00:52:27
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xujc1983

木虫 (著名写手)

苦逼青椒一枚
引用回帖:
7楼: Originally posted by liuyf1110 at 2012-08-14 00:52:27
理由就是我做的计算结果啊，曾经算过碳管不同长度的超胞结构优化，由多个小超胞组成的一个大超胞进行优化后，大超胞内的原来的小超胞部分不再是原来的严格周期平移对称，当然变化很小。您也可以算一下试试看嘛。...

好吧，你之前的解释我理解错了。我以为你说的是整个晶胞没有严格的平移对称性了。
对超胞进行几何优化，通常超胞内原子会有微小移动（超胞后对称性会变为P1），这时会像你说的那样晶胞内的平移对称不那么严格。
而如果你在优化之前find symmetry并impose的话，再进行优化的结构会保持晶胞内的严格对称性。
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8楼2012-08-14 01:32:19
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三岁薇恩

新虫 (正式写手)
请问在VMD里如何施加周期性
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9楼2019-11-20 23:00:52
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三岁薇恩

新虫 (正式写手)
前辈您好 请问扶手椅型石墨烯纳米带和锯齿型纳米带有原胞吗 如果有的话该怎么构建呢
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10楼2019-11-20 23:02:22
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