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阿博小硕士

铜虫 (小有名气)

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[交流] PCR与API生化试验

我鉴定了三种菌，通过做16SRDNA序列比对，这三种菌的基因序列完全一样，但是做API生化试验显示，只有两种菌是一样的，另一个菌跟这两种菌不一样。这是正常的么？是什么原因呢？PS：这些都是直接拿到专业的鉴定机构做的，不是我自己做的。而这个机构的最终结果是根据API生化试验的结果为准，他们给出的解释是PCR会存在误差。那么，哪位高手能给我解释一下，有没有16SrDNA序列完全一样但又不是同一个种的菌的原因呢？

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1楼2012-08-10 13:56:56

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独立寒秋

木虫 (正式写手)

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现象应该是正常的。16srDNA序列的结果只是鉴定细菌是否是同一株菌的一项指标，16s rDNA序列完全一样确实不能说明就是同一株菌株，如果要再区分的话，还可以通过pcr扩增其他的看家基因如gyrB，rpod，往往如果两株菌不是同一株菌的话，会在gyrb，rpod序列上区分开来。另外，简单一点的话，可以做box pcr，此技术可以直接区分细菌是否为同一株菌。PCR存在的误差是很小的，一般的taq酶保真性足以保证16s序列的准确性。鉴定机构所说的pcr存在误差这个解释我觉得有点牵强。

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