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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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阿博小硕士

铜虫 (小有名气)


[交流] PCR与API生化试验

我鉴定了三种菌,通过做16SRDNA序列比对,这三种菌的基因序列完全一样,但是做API生化试验显示,只有两种菌是一样的,另一个菌跟这两种菌不一样。这是正常的么?是什么原因呢?PS:这些都是直接拿到专业的鉴定机构做的,不是我自己做的。而这个机构的最终结果是根据API生化试验的结果为准,他们给出的解释是PCR会存在误差。那么,哪位高手能给我解释一下,有没有16SrDNA序列完全一样但又不是同一个种的菌的原因呢?
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独立寒秋

木虫 (正式写手)



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现象应该是正常的。16srDNA序列的结果只是鉴定细菌是否是同一株菌的一项指标,16s rDNA序列完全一样确实不能说明就是同一株菌株,如果要再区分的话,还可以通过pcr扩增其他的看家基因如gyrB,rpod,往往如果两株菌不是同一株菌的话,会在gyrb,rpod序列上区分开来。另外,简单一点的话,可以做box pcr,此技术可以直接区分细菌是否为同一株菌。PCR存在的误差是很小的,一般的taq酶保真性足以保证16s序列的准确性。鉴定机构所说的pcr存在误差这个解释我觉得有点牵强。
2楼2012-08-11 01:17:44
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