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Nature methods里介绍各种开源的显微镜图像处理软件
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http://www.nature.com/nmeth/focus/bioimageinformatics/index.html 有兴趣的可以下载文章看看 Software name Primary function Website μManager Image acquisition http://www.micro-manager.org/ ScanImage Image acquisition http://www.scanimage.org/ OMERO Image database http://www.openmicroscopy.org/ Bisque Image database http://www.bioimage.ucsb.edu/bisque/ OMERO.searcher Image content search http://murphylab.web.cmu.edu/software/searcher/ Bio-Formats Image format conversion http://www.openmicroscopy.org/ ImageJ Image analysis http://rsbweb.nih.gov/ij/ Fiji Image analysis http://www.fiji.sc/ BioImageXD Image analysis http://www.bioimagexd.net/ Icy Image analysis http://icy.bioimageanalysis.org/ CellProfiler Image analysis http://www.cellprofiler.org/ Vaa3D Visualization and image analysis http://www.vaa3d.org/ FarSight Visualization http://www.farsight-toolkit.org/ VTK Bioimaging library http://www.vtk.org/ ITK Bioimaging library http://www.itk.org/ OpenCV Bioimaging library http://opencv.willowgarage.com/wiki/ WND-CHARM Machine learning http://code.google.com/p/wnd-charm/ PSLID Machine learning http://pslid.org/ Ilastik Machine learning http://www.ilastik.org/ CellProfiler Analyst Machine learning and data analysis http://www.cellprofiler.org/ PatternUnmixer Machine learning http://murphylab.cbi.cmu.edu/software/ PatternUnmixer2.0/ CellOrganizer Machine learning, modeling and visualization http://cellorganizer.org/ KNIME Workflow system http://www.knime.org/ |
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