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冬冬201木虫 (小有名气)
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[求助]
EST 初学者求助
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| 刚接触EST，也可以说刚做分子这块，求助引物设计，怎么从NCBI上批量下载EST序列和利用Phrap软件对ESTs进行拼接。希望高手给指点下 |
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shenye.judy
木虫 (正式写手)
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【答案】应助回帖
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额，这个问题，只能回答如何从NCBI上批量下载EST序列： 1）NCBI网站，在搜索栏里面（本来是All database）选择EST，后面输入你要查找的名字，然后就有结果，你看一下结果有没有问题，确定搜索词没有问题。 2）结果的右上方有个“send to”，从后面的箭头里面选择你要的输出结果，比如：choose File，Format EST等，你自己看一下你想要的顺序，然后就可以下载了。 EST拼接没学会，我们以前直接找专业生物信息的人做的，不是说几下就会的，不知道现在有没有更先进的软件可以一键搞定的，这个得自己查查。 |
2楼2012-08-03 16:13:24
gungunak47 
铁虫 (初入文坛)
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【答案】应助回帖
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下载的话 在Send to下拉菜单中选择File，Format下拉菜单中选择FASTA，点击Create File将EST序列保存到本机硬盘 拼接用CAP3就能完成了，操作起来也方便 可以参考http://canon1645.blog.sohu.com/156277207.html 很详细 |
3楼2012-08-06 14:49:24