应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 求助高斯计算出错error：segmentation violation
21/1返回列表
查看: 4108  |  回复: 1
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

chengjie_l

铜虫 (小有名气)

[求助] 求助高斯计算出错error：segmentation violation

脚本文件

#!/bin/csh
#PBS -N yqfeng-07271545
#PBS -l nodes=1:ppn=24
#PBS -q yqfeng_queue
#PBS -j oe

set INPUT_F=1d1.gjf
set OUTPUT_F=1d1.log
set nprocs=`cat $PBS_NODEFILE | wc -l`
cd $PBS_O_WORKDIR

source /public/home/yqfeng/software/g09/bsd/g09.profile

g09 < $INPUT_F >& $OUTPUT_F
log最后几行
Error: segmentation violation
   rax 0000000000000000, rbx ffffffffffffffff, rcx ffffffffffffffff
   rdx 00000000000011fd, rsp 00007fff0a434cc8, rbp 00007fff0a4352a0
   rsi 000000000000000b, rdi 00000000000011fd, r8  00002b76a0d436e0
   r9  0000000000000000, r10 0000000000000000, r11 0000000000000202
   r12 0000000000000000, r13 0000000000000000, r14 00007fff0a4352e8
   r15 00002b76b9ce0f28
  --- traceback not available
输入文件
%chk=1d1.chk
%mem=46GB
%nproc=24
# opt b3lyp/6-31g(d,p) scrf=(cpcm,solvent=ethanol,pcm)

1d1

0 1
C              
C                  1    1.36794894
C                  2    1.44227616    1  107.09359687
N                  3    1.39054153    2  109.99215302    1   -3.39813017    0
C                  4    1.39330968    3  105.62170575    2    5.01822579    0
C                  5    4.70357957    4   93.20898403    3  172.05012622    0
C                  6    1.36494076    5   42.34712786    4 -167.10652130    0
C                  7    1.44519326    6  107.34581717    5    6.02003197    0
N                  8    1.40840061    7  109.32760565    6    3.05322545    0
C                  9    1.38052624    8  105.57236487    7   -5.66079442    0
C                  8    1.38975760    7  124.74289286    6 -168.19434752    0
C                 10    4.80826031    9   93.98410651    8 -173.77234051    0
C                 12    1.53956355   10   44.67151742    9  148.25806596    0
C                 13    1.52274769   12  102.94438678   10   -6.13053616    0
N                 14    1.38518383   13  110.30337851   12  -17.64500504    0
C                 15    1.38052428   14  108.55098229   13   19.36113526    0
C                 14    1.37420777   13  123.74562123   12  156.47145926    0
C                  3    3.80830369    2  141.98457423    1  160.71120805    0
C                 18    1.36263895    3  124.38219483    2 -173.49959722    0
C                 19    1.44874766   18  107.17449078    3    2.27029965    0
N                 20    1.38074354   19  110.21509782   18    3.65716079    0
C                 21    1.41047501   20  105.64273645   19   -4.72693266    0
C                 22    1.38862005   21  125.82146859   20 -169.79943694    0
C                 16    1.38080676   15  125.59768223   14  162.12392296    0
C                 11    1.49666074    8  118.33690469    7   -5.82476670    0
C                 23    1.49673466   22  118.53285910   21  176.51063071    0
C                 24    1.49759680   16  120.26874498   15 -166.07010006    0
C                 17    1.50218607   14  119.43755263   13   -6.21130733    0
C                 26    1.40270274   23  120.82161788   22   66.53439852    0
C                 29    1.39469121   26  120.50611224   23  179.72221819    0
C                 30    1.40188362   29  120.96807625   26   -0.09338031    0
C                 31    1.40152383   30  118.31660050   29   -0.22893308    0
C                 32    1.39497305   31  120.98000122   30    0.27453468    0
C                 27    1.40952255   24  118.35933212   16  119.48505795    0
C                 34    1.38888344   27  120.55665812   24  179.09359839    0
C                 35    1.39969371   34  119.96776221   27    0.08794894    0
C                 36    1.39780427   35  120.04902151   34    0.18259018    0
C                 37    1.39379896   36  120.07027784   35   -0.35224831    0
C                 28    1.40075175   17  121.93528163   14  105.64855739    0
C                 39    1.39571383   28  120.45940287   17  178.30707446    0
C                 40    1.40126487   39  121.08913140   28    0.18011790    0
C                 41    1.40151776   40  118.29285536   39   -0.50541659    0
C                 42    1.39482052   41  120.82809904   40    0.18370959    0
C                 25    1.40361262   11  120.59140318    8  -67.03396539    0
C                 44    1.39378289   25  120.51897975   11  179.94123582    0
C                 45    1.40288183   44  120.95440908   25    0.16302787    0
C                 46    1.40044792   45  118.31728787   44   -0.13593945    0
C                 47    1.39594198   46  120.99805628   45    0.05837549    0
O                 12    1.51362357   10  128.75474855    9   76.74856837    0
N                 49    1.46925469   12  107.82991939   10   32.53944873    0
C                 50    1.28667299   49  108.57214738   12    7.92584948    0
C                 51    1.48021033   50  119.98917355   49  178.16295441    0
C                 52    1.40421691   51  122.04108604   50   79.95632051    0
C                 53    1.39455758   52  121.59665117   51 -179.97135538    0
C                 54    1.39422798   53  119.53505080   52    0.59309703    0
C                 55    1.39425664   54  120.32237003   53   -0.01503249    0
C                 56    1.39192019   55  119.22549789   54   -0.24193103    0
Cl                57    1.75649035   56  118.60347752   55  179.78132287    0
Cl                53    1.75490852   52  120.20980064   51   -0.22216896    0
Zn                 9    1.95086507    8  126.73346156    7  179.21023689    0
C                 31    1.51847374   30  120.77168480   29  178.70274676    0
C                 46    1.51849869   45  120.52040080   44  179.18496036    0
C                 41    1.51827183   40  120.84288527   39  178.33728664    0
C                 36    1.47542962   35  117.54268421   34  179.99051405    0
O                 64    1.22976739   36  125.88413766   35    0.03251920    0
O                 64    1.38338369   36  111.83934744   35 -179.95600598    0
H                  1    1.07580355    2  127.93206078    3 -176.34790120    0
H                  2    1.07576439    1  127.97338296    5  176.66379528    0
H                  6    1.07559262    5  168.67300988    4  157.57949590    0
H                  7    1.07585733    6  127.94839045    5 -171.39668378    0
H                 12    1.08751209   10  123.78840482    9 -116.23068104    0
H                 13    1.08964062   12  116.94150687   10  119.39712457    0
H                 18    1.07573905    3  107.52929839    2   11.43745957    0
H                 19    1.07526477   18  127.94150963    3 -173.96879810    0
H                 29    1.08372267   26  119.20574994   23    0.45766425    0
H                 30    1.08505448   29  119.59488782   26 -179.51088069    0
H                 32    1.08495066   31  119.42453378   30 -179.93971059    0
H                 33    1.08375255   32  120.25114533   31  179.66323669    0
H                 34    1.08338156   27  119.08491475   24   -1.10763511    0
H                 35    1.08314499   34  121.60053229   27  179.73286871    0
H                 37    1.08134843   36  119.18147097   35  179.98136996    0
H                 38    1.08052997   37  120.50248457   36  178.45739200    0
H                 39    1.08308546   28  119.39211144   17   -1.91505164    0
H                 40    1.08497815   39  119.46673366   28  179.92249859    0
H                 42    1.08501048   41  119.48588438   40 -179.15297541    0
H                 43    1.08452859   42  120.11136874   41 -178.62172474    0
H                 44    1.08374476   25  119.17356764   11   -0.52199024    0
H                 45    1.08520229   44  119.59877741   25  179.78064886    0
H                 47    1.08486977   46  119.40231397   45 -179.54389529    0
H                 48    1.08375339   47  120.24340315   46 -179.44798778    0
H                 54    1.08160798   53  119.43491855   52 -179.90086766    0
H                 55    1.08307463   54  119.80246923   53  179.60336149    0
H                 56    1.08148471   55  121.16882158   54  179.51495625    0
H                 61    1.09493037   31  110.99099208   30   33.39665992    0
H                 61    1.09463841   31  110.99720245   30  154.02067382    0
H                 61    1.09780700   31  110.52731362   30  -86.27886983    0
H                 62    1.09597647   46  110.94962038   45   50.02195807    0
H                 62    1.09420440   46  110.94539328   45  170.42896072    0
H                 62    1.09725387   46  110.65491149   45  -69.63817378    0
H                 63    1.09488014   41  111.04369467   40   31.80835492    0
H                 63    1.09468090   41  111.01269831   40  152.45152037    0
H                 63    1.09777537   41  110.45953986   40  -87.89292386    0
H                 66    0.99575906   64  108.03362604   36 -179.92433752    0
回复此楼

» 猜你喜欢
1楼 2012-08-02 16:17:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yoghurt117

木虫 (正式写手)
http://www.ccl.net/chemistry/res ... 2011/12/30.003-dir/

CCl上的，错误类似，不知道对你有用么
赞一下 回复此楼
I am 废Man! 把握住每一刻才是最重要的！
2楼2012-08-03 19:58:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 chengjie_l 的主题更新
21/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[硕博家园] 极限拉扯，如何抉择 +11 Isak0320 2026-10-12 15/750 2026-10-14 21:55 by 猫鱼不是鱼
[基金申请] 申请科研项目纯靠实力能成功吗？ 200+5 David1982 2026-10-13 8/400 2026-10-14 21:38 by lhw_GPA4.0
[硕博家园] 中科院海洋所招收海洋材料相关领域博士研究生及研究助理 +3 sujiner 2026-10-08 4/200 2026-10-14 20:40 by qicaiyun
[职场人生] 40+中年人失业后，还能找到好工作吗？ +3 xqy2009 2026-10-13 3/150 2026-10-14 20:17 by 43358052
[论文投稿] 二审4个多月了还是Awaiting Reviewer Scores 10+3 纳斯达克ML 2026-10-11 4/200 2026-10-14 17:30 by babero
[有机交流] OpenAI又攻克数学难题了，离AI做有机合成还有多远？ +8 wangyl_123 2026-10-10 13/650 2026-10-14 15:12 by zuesli
[基金申请] 入职后第一次管课题组的专利缴费，对账才发现官费比别人多掏了一倍 +6 13108017953 2026-10-08 6/300 2026-10-12 20:07 by w3w3y3
[公派出国] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 9/450 2026-10-11 22:34 by XQNyDCa1Tk5n
[公派出国] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 10/500 2026-10-11 22:26 by XQNyDCa1Tk5n
[考博] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 9/450 2026-10-11 22:15 by XQNyDCa1Tk5n
[教师之家] 售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 (EPI+-1)(金币-50) +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 10/500 2026-10-11 22:06 by XQNyDCa1Tk5n
[教师之家] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 (EPI+-1)(金币-50) +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 10/500 2026-10-11 14:25 by VOMexwnDzOFZ
[教师之家] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 (EPI+-1)(金币-50) +4 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 7/350 2026-10-11 14:05 by VOMexwnDzOFZ
[硕博家园] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 8/400 2026-10-11 13:45 by VOMexwnDzOFZ
[找工作] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 7/350 2026-10-11 10:54 by VOMexwnDzOFZ
[找工作] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +4 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 7/350 2026-10-11 10:34 by VOMexwnDzOFZ
[考博] 招收博士生一名 +3 mandolin 2026-10-10 3/150 2026-10-11 10:21 by 不是山谷！
[公派出国] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +4 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 4/200 2026-10-11 03:14 by M0zrYVSAnxpE
[有机交流] 各位大佬，路线设计求助 +6 zapen 2026-10-08 8/400 2026-10-10 15:59 by zapen
[有机交流] 我应该选哪条合成路线让实验成功率高一些？ +5 jing816y 2026-10-08 9/450 2026-10-10 09:05 by zapen
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭