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mapanda

新虫 (初入文坛)

[求助] 氨基酸变化与蛋白质功能改变

请问一下一个氨基酸的变化会改变约460个氨基酸的蛋白质功能吗？我是由于一个碱基突变导致缬氨酸变成了异亮氨酸，对蛋白表达有影响吗？又是如何看待一个氨基酸是否为功能氨基酸呢？请教各位仁人义士！感激不尽啊！！！
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mapanda

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1楼 2012-07-27 15:22:11
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starseacow

专家顾问 (职业作家)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
只要不是同义突变，都很可能影响蛋白的功能，遇到这种情况，最好重做表达
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2楼2012-07-27 21:30:49
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mapanda

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by starseacow at 2012-07-27 21:30:49
只要不是同义突变，都很可能影响蛋白的功能，遇到这种情况，最好重做表达

我也知道不是同义突变就有可能，可是好不容易才挑到几个阳性克隆，偏偏在同一位点都有突变，如果重做，又得从头开始呀！伤不起啊~怎么样看一个氨基酸是不是功能氨基酸呢？
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3楼2012-07-28 16:06:37
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mapanda

新虫 (初入文坛)
送鲜花一朵
谢谢回复！
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4楼2012-07-28 16:11:48
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starseacow

专家顾问 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
小丹木木: 金币+3, 鼓励积极交流解答问题 2012-07-30 13:42:36
引用回帖:
3楼: Originally posted by mapanda at 2012-07-28 16:06:37
我也知道不是同义突变就有可能，可是好不容易才挑到几个阳性克隆，偏偏在同一位点都有突变，如果重做，又得从头开始呀！伤不起啊~怎么样看一个氨基酸是不是功能氨基酸呢？...

我还是建议你重做。要想确认突变氨基酸是否影响功能，需要你对蛋白三维结构和作用方式有全面的了解，而且很多蛋白质的功能可能是你根本无法预期的，因此任何一个突变都可能影响你日后的研究，有些结果就做不出来了。
当然，还存在一个可能性，你所认定的突变，是根据什么数据资料呢？有时候也有可能前人的报道中，使用的就是一个突变体。你最好重复一下，如果还是同一位点突变，那就有一定可能是这样的。
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植物生理群69993869，为避免广告，申请加入请提供木虫昵称，院校及专业信息
5楼2012-07-28 16:18:37
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mapanda

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
5楼: Originally posted by starseacow at 2012-07-28 16:18:37
我还是建议你重做。要想确认突变氨基酸是否影响功能，需要你对蛋白三维结构和作用方式有全面的了解，而且很多蛋白质的功能可能是你根本无法预期的，因此任何一个突变都可能影响你日后的研究，有些结果就做不出来了 ...

我是做载体构建的，切接连转筛，筛选的阳性克隆，然后拿去测序，几个单克隆都是同一位点突变了，
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6楼2012-07-29 15:53:52
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547star

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
小丹木木: 金币+2, 鼓励积极交流 2012-07-30 13:42:52
引用回帖:
3楼: Originally posted by mapanda at 2012-07-28 16:06:37
我也知道不是同义突变就有可能，可是好不容易才挑到几个阳性克隆，偏偏在同一位点都有突变，如果重做，又得从头开始呀！伤不起啊~怎么样看一个氨基酸是不是功能氨基酸呢？...

多次都是这个突变说明本来就是那个样子,不是突变,只是不同物种之间蛋白质的差异.
因为不知道是什么蛋白,单纯从缬氨酸变成了异亮氨酸这个说法,很难判断对功能有多大影响,虽然两种氨基酸是性质相似的氨基酸,而且密码字间往往因为只差一个碱基,容易相互突变.所以,另一个帮助判断的方法是进行BLAST,看看除了开始参考的序列是缬氨酸外,是不是有好几个序列在该位置是异亮氨酸.如果是,估计影响不大,毕竟脂肪族氨基酸多数起梳水核心的作用而已,对催化没有直接影响.
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为什么
7楼2012-07-29 16:57:41
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zc10052157

新虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
引用回帖:
3楼: Originally posted by mapanda at 2012-07-28 16:06:37
我也知道不是同义突变就有可能，可是好不容易才挑到几个阳性克隆，偏偏在同一位点都有突变，如果重做，又得从头开始呀！伤不起啊~怎么样看一个氨基酸是不是功能氨基酸呢？...

同一位点都有突变  应该是你的模板就是那样的   你可以先表达出来看看
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hold住
8楼2012-07-30 11:30:53
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