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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 【软件】【教程】pymod！！最强大的pymol多功能插件！！
汕头大学海洋科学接受调剂
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nnxqwei

至尊木虫 (职业作家)

[资源] 【软件】【教程】pymod！！最强大的pymol多功能插件！！

pymod是集序列相似性搜索，多序列比对以及同源建模于一体的pymol多功能插件，它包含有序列和结构分析最常用的程序，如PSI-BLAST, ClustalW, MUSCLE, CEalign and MODELLER，安装在pymol 的plugin menu 里，其功能十分强大，使用起来真是过瘾呀！！哈哈。pymod论文介绍：
PyMod: sequence similarity searches, multiple sequence-structure alignments, and homology modeling within PyMOL:

pymod 安装说明及下载地址：http://schubert.bio.uniroma1.it/pymod/index.html

至于PyMOL最好安装1.4以上的版本，老夫在论坛里上传有相关的软件！大家好好学习，天天向上！！
pymod 安装起来比较麻烦哦！！[ Last edited by silicare on 2012-10-20 at 10:07 ]
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1楼 2012-07-25 01:38:53
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nnxqwei

至尊木虫 (职业作家)
引用回帖:
13楼: Originally posted by nnxqwei at 2012-09-21 01:19:07
PyMod 对较新版本的pymol无法安装，PyMod_Installer 2.4 在pymol1.1.1版本可以使用！！...

PyMod_Installer 2.4 在pymol1.1.1版本的安装路径在C:\Program Files\DeLano Scientific\PyMOL
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14楼2012-09-21 01:21:31
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cuiyoutian88

金虫 (小有名气)
请问安装后插件里找不到pymod是因为什么呢?
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8楼2012-07-26 14:58:36
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nnxqwei

至尊木虫 (职业作家)
引用回帖:
8楼: Originally posted by cuiyoutian88 at 2012-07-26 14:58:36
请问安装后插件里找不到pymod是因为什么呢?

PyMod 对较新版本的pymol无法安装，PyMod_Installer 2.4 在pymol1.1.1版本可以使用！！
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11楼2012-08-19 04:29:21
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lezhiysl

新虫 (初入文坛)

★★★★★ 五星级,优秀推荐

楼主，请教个问题，我安装的时候那个 install 这个按钮一直是灰色的，我原先的PyMOL版本是0.99的，后面在论坛安装了你上传的1.4版本，PyMOD我下载了两个2.4和2.7，但是都不行，都是一样的现象 请楼主赐教下啊
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12楼2012-09-20 02:23:42
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独孤蚕3楼
2012-07-25 13:01   回复  
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独孤蚕4楼
2012-07-25 13:01   回复  
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jinhx875楼
2012-07-25 14:59   回复  
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sjshvdc7楼
2012-07-26 00:18   回复  
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Chengxm9楼
2012-07-26 16:43   回复  
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Chengxm10楼
2012-07-26 16:44   回复  
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