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晓晓瑶

铜虫 (小有名气)

[求助] 用swiss(SPV)软件看文件时的一些疑问

我做BSA与药物的结合
生成的pdb文件用spv软件打开
想问下1.怎么改变标注的氨基酸的标记字体的颜色,我改来改去都不对,郁闷死了呢
2.怎么看药物与BSA的结合的范德华力的影响,因为我做荧光实验做出来是主要影响力是范德华力,但是要表现出来的话,我该怎么在这个软件中操作呢,求高手
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zh1987hs

金虫 (著名写手)

分子模拟新手

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
chaizhm: 金币+3, 谢谢~ 2012-07-23 10:23:22
晓晓瑶: 金币+5, ★★★很有帮助 2012-07-23 19:05:00
你要做用于文章发表的图,最好还是用:
1.3D结合图-pymol
2.2D结合图-ligplot
3.无论是3D还是2D图,我所知的应该是只能体现氢键和疏水作用,以及π-π作用,范德华力的相互作用我还没看过文章里有所体现

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

2楼2012-07-23 10:02:36
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晓晓瑶

铜虫 (小有名气)

送鲜花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by zh1987hs at 2012-07-23 10:02:36
你要做用于文章发表的图,最好还是用:
1.3D结合图-pymol
2.2D结合图-ligplot
3.无论是3D还是2D图,我所知的应该是只能体现氢键和疏水作用,以及π-π作用,范德华力的相互作用我还没看过文章里有所体现

哦哦,那么我看结合在药物周围的貌似都是一些非极性氨基酸,那么能不能证明药物与BSA的主要作用是范德华力呢,主要是因为我荧光实验做出来就是这个结果呢。
3楼2012-07-23 19:04:43
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