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晓晓瑶

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[求助] 用swiss（SPV）软件看文件时的一些疑问

我做BSA与药物的结合
生成的pdb文件用spv软件打开
想问下1.怎么改变标注的氨基酸的标记字体的颜色，我改来改去都不对，郁闷死了呢
2.怎么看药物与BSA的结合的范德华力的影响，因为我做荧光实验做出来是主要影响力是范德华力，但是要表现出来的话，我该怎么在这个软件中操作呢，求高手

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1楼 2012-07-22 23:33:23

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zh1987hs

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【答案】应助回帖

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chaizhm: 金币+3, 谢谢~ 2012-07-23 10:23:22
晓晓瑶: 金币+5, ★★★很有帮助 2012-07-23 19:05:00

你要做用于文章发表的图，最好还是用：
1.3D结合图-pymol
2.2D结合图-ligplot
3.无论是3D还是2D图，我所知的应该是只能体现氢键和疏水作用，以及π-π作用，范德华力的相互作用我还没看过文章里有所体现

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晓晓瑶

2楼2012-07-23 10:02:36

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2楼: Originally posted by zh1987hs at 2012-07-23 10:02:36
你要做用于文章发表的图，最好还是用：
1.3D结合图-pymol
2.2D结合图-ligplot
3.无论是3D还是2D图，我所知的应该是只能体现氢键和疏水作用，以及π-π作用，范德华力的相互作用我还没看过文章里有所体现

哦哦，那么我看结合在药物周围的貌似都是一些非极性氨基酸，那么能不能证明药物与BSA的主要作用是范德华力呢，主要是因为我荧光实验做出来就是这个结果呢。

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3楼2012-07-23 19:04:43

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