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brouseyang

新虫 (初入文坛)

[交流] DGGE老跑偏,请达人们指点 已有5人参与

我做的是细菌的V3区,采用巢式PCR扩增,第二轮引物为341F-534R
带了GC夹子。电压80V,电泳10h。结果总是跑偏。每个样品有4个重复,现在只选了其中的三个,两边都留了梳孔没加样品。
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  • 2012-07-20 20:26:03, 787.21 K

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wangning__

木虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
你跑的是什么样品啊,怎么这么多条带,而且明显刚开始是一片?
乌拉拉
2楼2012-07-21 11:59:29
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hhz0104

金虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
lz上胶板后有没有检查过是否存在漏液现象?
3楼2012-07-21 14:10:00
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jipojiong

木虫 (小有名气)

★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
小丹木木: 金币+2, 鼓励交流 2012-10-31 15:11:57
条带还行,能看清楚。如果跑正了就完美了。
分析两个原因:1,灌胶后有点漏液,看看左下角的弯曲的条带就看出来了,有点边缘效应;2,可能是设备的问题,电泳仪的电流自上而下不是垂直的,导致电泳泳道上面窄,下面宽,建议找厂家工程师问问情况。

算是抛砖引玉吧
咦~飞碟!!
4楼2012-07-21 16:50:41
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在雨中

金虫 (著名写手)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
呵呵,这个图看着有点不舒服,怎么做成这个样子呀。。。。
5楼2012-10-31 12:50:24
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在雨中

金虫 (著名写手)


把样品丢给我吧,我给你做,最近闲
6楼2012-10-31 12:50:43
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zhang226296

新虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
我也是做细菌的V3区,引物为341F-534R,请问你的变性梯度和聚丙烯酰胺浓度是多少啊,问什么我什么梯度的胶都是条带在下部,上部没有啊,愁死我了。求赐教啊
7楼2014-03-23 19:01:39
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