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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » DGGE老跑偏，请达人们指点
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brouseyang

新虫 (初入文坛)

[交流] DGGE老跑偏，请达人们指点 已有5人参与

我做的是细菌的V3区，采用巢式PCR扩增，第二轮引物为341F-534R
带了GC夹子。电压80V，电泳10h。结果总是跑偏。每个样品有4个重复，现在只选了其中的三个，两边都留了梳孔没加样品。
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    • 2012-07-20 20:26:03, 787.21 K

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1楼 2012-07-20 20:26:49
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wangning__

木虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
你跑的是什么样品啊，怎么这么多条带，而且明显刚开始是一片？
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乌拉拉
2楼2012-07-21 11:59:29
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hhz0104

金虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
lz上胶板后有没有检查过是否存在漏液现象？
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3楼2012-07-21 14:10:00
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jipojiong

木虫 (小有名气)
★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
小丹木木: 金币+2, 鼓励交流 2012-10-31 15:11:57
条带还行，能看清楚。如果跑正了就完美了。
分析两个原因：1，灌胶后有点漏液，看看左下角的弯曲的条带就看出来了，有点边缘效应；2，可能是设备的问题，电泳仪的电流自上而下不是垂直的，导致电泳泳道上面窄，下面宽，建议找厂家工程师问问情况。

算是抛砖引玉吧
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咦~飞碟！！
4楼2012-07-21 16:50:41
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在雨中

金虫 (著名写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
呵呵，这个图看着有点不舒服，怎么做成这个样子呀。。。。
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5楼2012-10-31 12:50:24
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在雨中

金虫 (著名写手)
把样品丢给我吧，我给你做，最近闲
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6楼2012-10-31 12:50:43
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zhang226296

新虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
我也是做细菌的V3区，引物为341F-534R，请问你的变性梯度和聚丙烯酰胺浓度是多少啊，问什么我什么梯度的胶都是条带在下部，上部没有啊，愁死我了。求赐教啊
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7楼2014-03-23 19:01:39
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