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slandp

金虫 (小有名气)

[求助] 关于金属配合物的模拟求助

最近在做金属离子(如Cu2+)的配合物结果优化,但是出现很多问题:
构建模型时,我用单键表示配位键,有4个配位键,电荷我定了2,自旋多重度也是,然后用HF里面的LanL2DZ优化,由于我是在网上计算的,没到8秒就给毙了。
我用自己的计算机用PM3优化的时候出的错是说,“铜原子有11个价态,但只有4个基函数……”
哪位大侠做过金属配合物的优化呵,能不能指导下我如果写输入文件,或者我该看高斯手册那一部分,有木有什么参考资料啊,实在是纠结!!!
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yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)

密度泛函·小卒

优秀版主

【答案】应助回帖

★ ★ ★
zhou2009: 金币+3 2012-07-31 09:36:29
那就先看看小机组能不能行吧
铜这种东西大多使用赝势基组的 所以6-31g啊3-21g的都不好 而且你还没加极化函数 更不好
如果是我 我宁可去用M05/06系列 加上三重劈裂 加上大极化和弥散 再加上赝势 否则哪怕收敛算出来了 读者也不信呀
7楼2012-07-27 22:02:03
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普通回帖

gujing136

禁虫 (文坛精英)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
没做过铜的,不过你可以先把你要优化的物质的结构贴出来··
叫老猫的兔子
2楼2012-07-20 11:21:45
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slandp

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by gujing136 at 2012-07-20 11:21:45
没做过铜的,不过你可以先把你要优化的物质的结构贴出来··

嗯嗯,我做了chemdraw的图,然后截了初始结构,如下

这个就是我要做的配合物,由于4位的羰基和5为的羟基容易形成分子内氢键,我没有考虑在这里配位,只用了邻2酚羟基。



这个是我的初始结构,配位键我定在2.1左右,一开始用实线表示的配位键

3楼2012-07-21 12:58:54
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gujing136

禁虫 (文坛精英)

【答案】应助回帖

★ ★
zhou2009: 金币+2 2012-07-23 10:22:14
引用回帖:
3楼: Originally posted by slandp at 2012-07-21 12:58:54
嗯嗯,我做了chemdraw的图,然后截了初始结构,如下
31/b7/1351430_1342846243_377.jpg
这个就是我要做的配合物,由于4位的羰基和5为的羟基容易形成分子内氢键,我没有考虑在这里配位,只用了邻2酚羟基。
52/17/13 ...

同学,因为铜是属于过渡金属了,这个貌似比较有讲究,我没有做过这个东西。你在网上搜索一下过渡金属的基组设置,然后在你这个体系里面设置不同的基组看看可以不。还有,你也可以考虑换方法。电荷和多重度貌似没有什么问题,然后L502的错误,应该就是结构、方法基组的问题了,你可以去网上搜索一下收敛问题的解决··
叫老猫的兔子
4楼2012-07-21 19:11:41
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easygeton

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
zhou2009: 金币+2 2012-07-23 10:22:52
pm3不能算铜吧,g09的PM6方法可以
5楼2012-07-22 17:20:44
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slandp

金虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by easygeton at 2012-07-22 17:20:44
pm3不能算铜吧,g09的PM6方法可以

是的,G03的一直算不了,现改用小基组3-21g在算,6-31g和lanl2dz都收敛失败。
6楼2012-07-22 20:24:48
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ZZU2011

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
zhou2009: 金币+2 2012-07-31 09:36:57
你可以先用低基组的PM6先优化一下,然后再升高基组用B3LYP方法优化,用B3LYP方法优化时,CU加赝势,这样应该没有问题了,我做过二茂铁的分子,就是这样优化的,结果还不错
8楼2012-07-31 08:14:09
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meteoric30

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
zhou2009: 金币+2 2012-07-31 09:37:22
要加ecp啊 land2dz
9楼2012-07-31 09:15:54
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钓鱼大神

铜虫 (小有名气)

很好,多交流。这个软件选择什么好呢?
10楼2012-11-21 11:04:08
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