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linxi8579

铜虫 (正式写手)

[交流] bar基因

请教一下大家有木有使用bar基因作抗性筛选标记的，就是抗草甘膦的。我想知道构建敲除片段时这个基因的序列，我在NCBI上查的有4Kb，感觉太长了。构建的时候一般有多长呢?谢谢大家啦。
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1楼 2012-07-10 22:13:38
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

bired

木虫 (著名写手)
★ ★
linxi8579: 金币+2 2012-07-12 08:15:56
当草甘磷的说法绝对是错的。
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8楼2012-07-11 10:52:00
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bired

木虫 (著名写手)
★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
linxi8579: 金币+2 2012-07-11 08:43:49
bar
是草丁磷，不是草甘磷，呵呵。顺便问问是在植物里面敲掉吗？
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3楼2012-07-11 00:11:22
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linxi8579

铜虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by bired at 2012-07-11 00:11:22
bar
是草丁磷，不是草甘磷，呵呵。顺便问问是在植物里面敲掉吗？

哦，呵呵，有的地方也这么叫呢。我是敲真菌呢，您有构建序列吗？
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5楼2012-07-11 08:43:39
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bired

木虫 (著名写手)
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
silicare: 金币+5, 应助指数+1, 谢谢参与 2012-07-11 12:01:42
linxi8579: 金币+6 2012-07-12 08:11:43
ncbi上可以下。1 cagaggaccg tgacctcgtc gttcctcatc agagacattc ttgcggactg taagcctctg
       61 gctgcgtgcg cgccgtactc cagcaatgga cagccgaccc aggaggcggg gaggctggcc
      121 tcaaagatag cagacgactt tatggagaaa atccacagca actcttcgtc tgacagtgaa
      181 tacaaagtga aggaggaggg ggacagggag atctccagca gcagggacag cccgcaggtc
      241 cggctgaaga agcccaggaa ggcccgcacg gccttcacgg accaccagct ggcgcagctg
      301 gagcgcagct tcgagcgcca gaagtacctg agcgtccagg accgcatgga gctagcggcc
      361 tccctgaacc tcaccgacac gcaggtcaag acctggtacc agaatcggag gacaaagtgg
      421 aagaggcaga cggcggtggg gctggagctg ctggcagagg ccgggaacta ctccgccctg
      481 cagaggatgt tccccagccc ctacttctac ccgcagagcc tggtgtccaa cttggacccc
      541 ggggcggccc tgtacctgta caggggcccc tcggcgcccc cgccagctct acagagaccc
      601 ctggttccgc ggtga
//
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7楼2012-07-11 10:51:20
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克隆大虾

铁杆木虫 (著名写手)
★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
linxi8579: 金币+3 2012-07-12 08:20:24
这个基因长度在700左右吧。你可以加个真菌的启动子就可以用了..
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9楼2012-07-11 12:57:22
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linxi8579

铜虫 (正式写手)
引用回帖:
7楼: Originally posted by bired at 2012-07-11 10:51:20
ncbi上可以下。1 cagaggaccg tgacctcgtc gttcctcatc agagacattc ttgcggactg taagcctctg
       61 gctgcgtgcg cgccgtactc cagcaatgga cagccgaccc aggaggcggg gaggctggcc
      121 tcaaagatag cagacgactt tatggag ...

再确定一下噶，这个序列是可以自主表达的吗，启动子终止子都完整了吗？因为我是要构建到敲除片段里的，所以这个问题想问一下。NCBI里我也查过，就是不能确定这个问题呢。既想短一点便于构建导入又必须保证完整自主表达呢。谢谢啦。
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10楼2012-07-12 08:14:10
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linxi8579

铜虫 (正式写手)
引用回帖:
8楼: Originally posted by bired at 2012-07-11 10:52:00
当草甘磷的说法绝对是错的。

哦，好的，谢谢啦。
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11楼2012-07-12 08:15:48
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linxi8579

铜虫 (正式写手)
引用回帖:
9楼: Originally posted by 克隆大虾 at 2012-07-11 12:57:22
这个基因长度在700左右吧。你可以加个真菌的启动子就可以用了..

我想最好是要自主表达的呢，因为是构建到敲出片段里的嘛，敲除基因每次构建都要用到的。谢谢指点噶。
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12楼2012-07-12 08:17:18
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JimWolverine2楼
2012-07-10 23:08   回复  
a20102960784楼
2012-07-11 00:13   回复  
pshuai6楼
2012-07-11 08:44   回复  
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