| 查看: 1468 | 回复: 7 | ||||||
| 【奖励】 本帖被评价7次，作者10010602004增加金币 5.6 个 | ||||||
[资源]
batch_g03升级batch_auto_g03 啦！
|
||||||
|
闲着无事，总想找事。呵呵，每次忙于g03提交任务时，总是感觉有些缺憾，我们看一下其网上批处理代码： (转载请注明出处！) &&&&&&&&&&&&&&&&batch_g03.sh #!/bin/bash for inf in *.gjf do dos2unix ${inf} g03 ${inf} done &&&&&&&&&&&&&&&&&&finish 虽然简洁，但其有几个缺点： 1、无法处理文件格式为com,txt型的文件类型; 2、每当自己用batch_g03.sh提交任务时，有些欣慰，因为总算省去了我大量单个g03任务的提交. 可是又遇到了点问题，当我再次把文件拖放相应的文件夹时，它就死不干活了！！ 于是自己再次对其研究希望可以改进以上两点不足,整理的代码为： &&&&&&&&&&&&&&&&&batch_auto_g03.sh #!/bin/bash mkdir -p ../completion 2>/dev/null batch_auto_g03 () { for inf in `ls -rt | head -n 1 |awk '{print $1}'` do dos2unix ${inf} g03 ${inf} & wait mv ${inf} ../completion 2>/dev/null #添加g03产生的文件类型,把它转移放到建好的/completion文件夹下 mv *.chk ../completion 2>/dev/null mv *.log ../completion 2>/dev/null mv *.cube ../completion 2>/dev/null mv *.4* ../completion 2>/dev/null mv *.3* ../completion 2>/dev/null mv *.wfn ../completion 2>/dev/null done } SLEEPTIM=5 #自动运行,省去每次的batch_g03,只要把你的文件拖到你需要批处理的文件夹下！搞定！ while true ; do batch_auto_g03 sleep $SLEEPTIM done &&&&&&&&&&&&&&&&&&finish 说明： 1、这个小shell是基于bash shell的, 肯定大家所用电脑已安装, 当然其它shell也应该可以处理,但我没测试; 2、注意到mv命令, 如果g03还能生成你需要的问价类型, 但在mv中没有看到该类型, 那请自行添加, 格式如： mv *.chk ../completion 2>/dev/null ------> mv *.自己的文件类型 ../completion 2>/dev/null 如果没有转移, g03可能会把该文件再提交一遍又生成一个log(其错误的), 使得把原来生成的log文件,再次替换而出错！ 3、这个小脚本的另一个优点是,可以按文件的时间的的先后顺序依次提交任务,可想而知会给我们带来很大方便！ 用法： 1、该文件已经上传为附件,把它放在你的batch_g03文件所在的位置,即通常放在g03文件的目录下(系统路径所在目录); 2、chmod +x batch_auto_g03.sh 给改文件添加可执行权限; 3、cd到你需要的批处理的文件夹下，然后batch_auto_g03.sh &; 4、在上一级程序自动创建的/completion文件找你的结果吧！ 小结：这是g03用户居家旅行的必备良药, 可以在你工作, 旅行时事半功倍, 呵呵开玩笑了！ 补充：假如一次性提交了一批作业, 但突然想把某个文件提前算一下, 那么只要把这个文件的修改时间改一下就可以了, 例如把某个文件修改在3天以前： $ touch -d "3 days ago" test.com 当把当前文件算完之后，就开始算test.com文件了！ 如有不合理之处大家提议, 毕竟我才花了3,4天写研究的小小脚本, 其肯定不够简洁或还有一点错误！谢谢！[ Last edited by 10010602004 on 2012-7-1 at 18:10 ] |
回复此楼» 本帖附件资源列表
-
欢迎监督和反馈：小木虫仅提供交流平台，不对该内容负责。
本内容由用户自主发布，如果其内容涉及到知识产权问题，其责任在于用户本人，如对版权有异议，请联系邮箱：xiaomuchong@tal.com - 附件 1 : batch_auto_g03.sh
2012-06-30 20:19:41, 635 bytes
» 收录本帖的淘帖专辑推荐
 计算 | Linux，高斯等相关知识 | Interesting Materials | 量化程序使用方法——Caussian,NBO,Mult,S |
» 猜你喜欢
美国杰克逊州立大学周剑歌教授的化学计算与AI实验室诚聘博士后研究员
已经有4人回复
-
博士生招生, 材料模拟方向，University of South Carolina
已经有3人回复
-
物理化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有245人回复
-
博士生招生, 材料模拟方向，University of South Carolina
已经有0人回复
-
Tc数据拟合
已经有1人回复
-
韩国釜山大学储能电池与功能材料实验室诚招博后（电池/电化学/器件制备/MOF合成）
已经有187人回复
-
祈福！
已经有79人回复
-
散金求好运
已经有102人回复
-
博士生招生, 材料模拟方向，University of South Carolina
已经有0人回复
-
Postdoc position, materials simulations/machine learning, U. of South Carolina
已经有0人回复
-
祈福青基
已经有34人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 怎样通过*.chk文件看相应结构的轨道分析
已经有6人回复
- okay03消息的疑点。
已经有10人回复
- 运行NBO计算出错
已经有3人回复
- 涂覆量及不同粘结剂PVDF会影响循环吗
已经有9人回复
6楼2012-07-02 19:49:21
简单回复
2012-07-01 07:51
回复
五星好评 顶一下，感谢分享！
2012-07-01 09:09
回复
五星好评 顶一下，感谢分享！
wy12344楼
2012-07-01 10:12
回复
五星好评 
游子89215楼
2012-07-01 22:35
回复
五星好评 顶一下，感谢分享！
ZDBWHZ7楼
2012-07-02 22:23
回复
五星好评 顶一下，感谢分享！
2012-07-10 16:59
回复
五星好评 
