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xiongxiong5712新虫 (小有名气)
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[求助]
提交siesta任务计算失败
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请教siesta的output文件提示这个是什么意思： p0_17810: p4_error: Child process exited while making connection to remote process on c0108: 0 p0_17810: (6.070312) net_send: could not write to fd=4, errno = 32 |
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 siesta问题 |
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4楼2012-06-07 10:18:13
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[lxiong@console LV30-k1]$ vi pbssiesta #!/bin/bash #PBS -l nodes=1:ppn=4 #PBS -N Si3N4 #PBS -l walltime=480:00:00 #PBS -l cput=480:00:00 #PBS -q students cd $PBS_O_WORKDIR echo `cat $PBS_NODEFILE` NPROCS=`wc -l < $PBS_NODEFILE` echo This job has allocated $NPROCS nodes mpirun -machinefile $PBS_NODEFILE -np $NPROCS /export/software/siesta-3.0-rc2/O bj/siesta < in.fdf|tee output ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ "pbssiesta" [readonly] 11L, 341C 11,1 All #!/bin/bash #PBS -l nodes=1:ppn=4 #PBS -N Si3N4 #PBS -l walltime=480:00:00 #PBS -l cput=480:00:00 #PBS -q students cd $PBS_O_WORKDIR echo `cat $PBS_NODEFILE` NPROCS=`wc -l < $PBS_NODEFILE` echo This job has allocated $NPROCS nodes mpirun -machinefile $PBS_NODEFILE -np $NPROCS /export/software/siesta-3.0-rc2/Obj/siesta < in.fdf|tee output ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ [lxiong@console LV30-k1]$ qsub pbssiesta 4896.console 立即查看： [lxiong@console LV30-k1]$ qstat Job id Name User Time Use S Queue ------------------------- ---------------- --------------- -------- - ----- 4896.console Si3N4 lxiong 0 R students 再次查看已经停止计算了： [lxiong@console LV30-k1]$ qstat Job id Name User Time Use S Queue ------------------------- ---------------- --------------- -------- - ----- 4896.console Si3N4 lxiong 00:00:00 C students |
5楼2012-06-08 09:14:08