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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 做过荧光淬灭或分子信标的大虫进来!
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yayah

新虫 (初入文坛)

[求助] 做过荧光淬灭或分子信标的大虫进来!

我想在一段探针一端标记淬灭基团,在靶标序列的末端标记报告基团,那么,要使得探针和靶标序列结合后荧光被淬灭,则这两个基团最大能相距多少个碱基?
用什么荧光/淬灭对比较好？
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1楼 2012-05-12 00:50:09
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microinsect

铁杆木虫 (正式写手)
你这是要做荧光共振能量转移呀，做分子尺，测量DNA的长度变化。
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2楼2012-05-13 09:02:54
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yayah

新虫 (初入文坛)
回楼上大虫,不是作分子尺.我是设计一个实验,这个实验需要循环重复N轮,我期待每一轮都可以用荧光变化来表明成功与否,所以,需要知道这两个基团最大相隔多少bp都还能保证淬灭,方便我实验设计.
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3楼2012-05-13 20:28:34
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凌波丽

专家顾问 (知名作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
yayah: 金币+5, ★★★很有帮助, ALexa532和BHQ-1，一端在探针3‘上，探针与靶序列结合，再设计一新探针，新探针3’再标基团。两探针结合位置不同。现两个基团大概相聚14-18个bp，按10nm算，应该在这个区间内，请大虫确认一下！ 2012-05-21 12:25:14
请说明具体讨论的内容。两个基团能够发生能量转移的最大能相距是10nm.
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4楼2012-05-18 11:57:07
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