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guevara1967

铁杆木虫 (著名写手)

[交流] Thermo LTQ Orbitrap与QTOF的同位素丰度比 已有7人参与

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http://msky.in/?p=67

Thermo LTQ Orbitrap的同位素丰度比不准

好似听谁说过,Orbitrap测定的同位素丰度比例不准确,这是它的一个缺点。今天我也遇到了这个问题,我们用理论的同位素比例与实测的进行比较,发现差别有点大:

上图蓝线为实测数据,红线为IsoPro模拟的数据。
在网上检索到两篇文章,一篇是Agilent 6540 UHD Q-TOF与Orbitrap比较的软文,一篇是Orbitrap的发明人Alexander Makarov发表在JASMS上好文。
Agilent的软文认为,随着Orbitrap分辨率的提高,化合物的同位素峰的丰度比与理论值的偏差变大,且提高Orbitrap的扫描速度,会使某化合物的A+2同位素峰不能准确测定。

而用agilent的6540则可以很精确的测定同位素丰度比:

对于从精确质量确定分子式来说,虽然质量精度越高越好,但很多时候即便有0.1Da的精度,也不能确定元素组成。有文献说,具有3ppm准确度加2%RIA的仪器,比可以准确到0.1Da但没有同位素丰度信息的仪器,更能准确确定化合物的元素组成。从这个角度说,确实6540占有一定优势。不过,Orbitrap的优势在于高分辨率,不仅在于确定化合物的元素组成,还在于当分析复杂体系时,具有可检测更多的能力,即便化合物的精确质量相差10mDa,也有可能将它们分开。
Alexander介绍了高场Orbitrap的性能,下图是Orbitrap与ICR等仪器,随质核比的增加,分辨率的变化情况:

FTICR在小分子区域有超高的分辨率,而在分子量大于1000时,Orbitrap的分辨率优势就开始体现。高场Orbitrap和低场Orbitrap的变化趋势,与高低场的FTICR一致,都是场强越高,分辨率越高。
“Evaluation of Accurate Mass and Relative Isotopic Abundance Measurements in the LTQ-Orbitrap Mass Spectrometer for Further Metabolomics Database Building”, http://pubs.acs.org/doi/abs/10.1021/ac100271j
该文的结论:离子的强度对化合物的relative isotope abundance (RIA)影响最大,应该设定强度限,以使RIA的误差<20%;FIA不如LC-MS;随着MS分辨率的提高,RIA误差倾向于负值,但方差统计不显著;减少m/z扫描范围可以提高RIA的测量精度;用峰高比峰面积更能提高RIA的准确度.
A Strategy for the Determination of the Elemental Composition by Fourier Transform Ion Cyclotron Resonance Mass Spectrometry Based on Isotopic Peak Ratios, http://pubs.acs.org/doi/pdfplus/10.1021/ac902931x

随着质谱精度的提高,候选分子式的数目大大减少。

[ Last edited by guevara1967 on 2012-4-30 at 20:14 ]
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高增明

铁虫 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
你好,你们那有LTQ-Orbitrap检测设备吗?对外检测吗?我想检测一下我的样品,能留联系方式吗?
7楼2016-02-21 11:02:01
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查看全部 8 个回答
送鲜花一朵
谢谢分享~~~
2楼2012-04-30 21:22:42
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huchen

新虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
这个问题,我也遇到过,我目前采用thermo Exactive型号仪器,遇到这个问题。
3楼2012-05-02 16:06:45
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wakan

木虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
这个主题很专业,对于使用轨道阱和飞行时间等高分辨率质谱的非常实用,谢谢分享。。。。。。
4楼2012-05-02 19:42:42
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