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gujing136

禁虫 (文坛精英)

[交流] 高斯批处理 已有3人参与

在win下面的批处理
1 . 多个输入文件写入一个列表中,统一执行:创建.bcf文件(用txt文档改名即可),每一行都是E:\QCexperiment\exp3\b1.gjf,b1.out (即文件路径名)。用gaussian打开此文件后,蹦出来的窗口先exit,然后点三角箭头开始运行。也可以用gaussian的Utilities-edit batch list来编辑批处理任务列表,可保存成.bcf。这个方法一个著名的问题是其中一个任务出错,整个批处理就会断掉。其实上可以在G03W界面的file-preference-Process里面设定来解决,将默认的"End Batch Run on Error"去掉,则运行中某任务出错将继续执行下面的任务。"Prompt Message"如果去掉的话,批量运行过程中将不再出现任何对话框,例如是否覆盖以前输出文件之类将不再提示,适合无人看管的情况下批量执行。
2. 多个工作写入一个文件中,统一执行:写一个输入文件,里面用例如--Link1--隔开。实际就是那个addition step方法创建的。这种方式适合多个任务有明显相关性的时候,将它们和在一起。
3. 在gaussian03W文件夹里面建立一个批处理文件k.bat(必须和g03.exe)放在一起,要自动计算d:\study\2.gjf和d:\study\3.gjf两个文件,然后将结果生成到e:\下面,分别叫2p.out和3p.out,那么bat文件里就写:
g03 d:\study\2 e:\2p
g03 d:\study\3 e:\3p
然后运行k.bat就可以自动计算了,只是看不到运行过程。注意别写后缀名,.gjf和.out不用写,自动默认读取.gjf和生成.out。如果不写输出文件的路径,就默认成生成和gjf同文件名的out文件在原gjf文件夹里。

转自人人http://blog.renren.com/share/221370463/3079774505

在linux下批处理
写一个x.in文件
nohup g03 a.com a.log &
wait
nohup g03 b.com b.log &
wait
nohup g03 c.com c.log &
然后保存  
然后再sh x.in &

转自小卒大人的回复
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?fid=290&tid=1291583&authorid=448368

以上本人用过,可以计算。

[ Last edited by gujing136 on 2012-5-9 at 09:30 ]
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叫老猫的兔子
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yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)

密度泛函·小卒

优秀版主

★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
送鲜花一朵
gmy1990: 金币+3 2012-05-01 11:30:25
感动的哭了
我09年的回复,12年被人挖出来了
其实这些内容已经整理到GaussianFAQ里了
===========以下内容引用自GaussianFAQ============
(1.6)
Gaussian如何实现批处理?
引用回帖:
如果你有三个文件分别进行计算
这三个文件叫做a.gjf,b.gjf和c.gjf
那么可以进行的批处理方法是:

1)Linux下
写一个文件x.in,内容如下
==文件开始==
nohup g03 a.gjf a.log &
wait
nohup g03 b.gjf b.log &
wait
nohup g03 c.gjf c.log &
==文件结束==
然后提交这个文件,命令为sh x.in &

2)Window下
写一个文件x.bcf,内容如下
==文件开始==
!start=1
a.gjf , a.out
b.gjf , b.out
c.gjf , c.out
==文件结束==
然后用G03运行这个文件

3)Linux和Windows通用
把三个gjf文件写成一个gjf,内容如下
==文件开始==
a.gjf的全部内容(原封不动照抄)
(空行)
--link1--
b.gjf的全部内容(原封不动照抄)
(空行)
--link1--
c.gjf的全部内容(原封不动照抄)
==文件结束==

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

2楼2012-04-29 21:55:44
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gujing136

禁虫 (文坛精英)

送鲜花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by yjcmwgk at 2012-04-29 21:55:44:
感动的哭了
我09年的回复,12年被人挖出来了
其实这些内容已经整理到GaussianFAQ里了
===========以下内容引用自GaussianFAQ============
(1.6)
Gaussian如何实现批处理?
引用回帖:
如果你有三个 ...

久闻小卒大人大名,嘿嘿···
叫老猫的兔子
3楼2012-04-29 22:02:02
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yumu0411

金虫 (著名写手)

打酱油

关注!
学习学习再学习
4楼2012-04-30 07:59:00
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gujing136

禁虫 (文坛精英)

引用回帖:
4楼: Originally posted by yumu0411 at 2012-04-30 07:59:00:
关注!

谢谢··
叫老猫的兔子
5楼2012-04-30 11:49:12
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ValYu

银虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
我在windows下批处理有一个问题。我新建文本文档写的批处理文件没有用,用g09打开此文件后出来的窗口不是批处理的窗口,而是和单任务相同的窗口,只不过里面什么也没写,要是运行的话直接出错,出错信息是Route card not found.
Error termination via Lnk1e in d:\G09W\l1.exe at Sat May 19 14:19:06 2012.
但是我打开g09w\tests\submit.bcf,把它修改为同样的内容后另存为一个新的bcf文件,再用g09打开就一切正常了。两个bcf文件内容一样,路径也相同,怎么会有这样的区别?
生命灿烂,精神永恒
6楼2012-05-19 14:24:19
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gujing136

禁虫 (文坛精英)

引用回帖:
6楼: Originally posted by ValYu at 2012-05-19 14:24:19:
我在windows下批处理有一个问题。我新建文本文档写的批处理文件没有用,用g09打开此文件后出来的窗口不是批处理的窗口,而是和单任务相同的窗口,只不过里面什么也没写,要是运行的话直接出错,出错信息是Route c ...

把你的东西贴出来,传附件……
叫老猫的兔子
7楼2012-05-19 15:43:16
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ValYu

银虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
不用了,我发现问题了。跟内容确实没有关系,原来是批处理文件的文件名长度有限制!文件名长度最多9位,10位以上Gaussian就不认!我是win7下的G09
生命灿烂,精神永恒
8楼2012-05-19 20:41:39
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ValYu

银虫 (小有名气)

引用回帖:
7楼: Originally posted by gujing136 at 2012-05-19 15:43:16:
把你的东西贴出来,传附件……

见8楼
生命灿烂,精神永恒
9楼2012-05-19 20:42:10
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