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fd_wonder

银虫 (初入文坛)

[求助] Gaussview作图出来的给Gaussian的input file的格式问题,小白求帮助~~

只是想问这个内坐标之后的一堆从1到22的参数是什么啊。。。

%chk=D:\Drivers\Group2\Gaussview files\q2-2.chk
# opt=modredundant b3lyp/3-21g* geom=connectivity

q2

0 1
C              
H                  1    1.07000000
C                  1    1.54000000    2  138.16968601
H                  3    1.07000000    1  109.47122105    2  -95.02968017    0
H                  3    1.07000000    1  109.47122073    2   24.97031993    0
H                  3    1.07000000    1  109.47122075    2  144.97031962    0
C                  1    1.54000000    3   87.15864072    4 -172.56588855    0
O                  7    1.25840000    1  120.00000021    3  -18.67259321    0
N                  7    1.47000000    1  119.99999999    3  161.32740580    0
H                  9    1.00000001    7  109.47122065    1  -29.99999921    0
C                  9    1.46999999    7  109.47122085    1 -149.99999959    0
H                 11    1.07000001    9  109.47122075    7 -180.00000000    0
H                 11    1.07000000    9  109.47122061    7  -60.00000001    0
H                 11    1.07000000    9  109.47122091    7   60.00000025    0
N                  1    1.47000000    3   82.31301271    7  140.16145694    0
H                 15    1.00000000    1  109.47122063    3 -173.14427045    0
C                 15    1.47000000    1  109.47122059    3   66.85572989    0
O                 17    1.25840000   15  119.99999994    1 -150.00000023    0
H                 17    1.84604170   15  104.18119024    1   -4.42125601    0
C                 17    1.54000000   15  119.99999994    1   29.99999984    0
H                 20    1.07000000   17  120.15844937   15 -156.18696682    0
H                 20    1.07000000   17  119.60459788   15   17.27970348    0

1 2 1.0 3 1.0 7 1.0 15 1.0
2
3 4 1.0 5 1.0 6 1.0
4
5
6
7 8 2.0 9 1.0
8
9 10 1.0 11 1.0
10
11 12 1.0 13 1.0 14 1.0
12
13
14
15 16 1.0 17 1.0
16
17 18 2.0 20 1.0
18
19 20 1.0
20 21 1.0 22 1.0
21
22

D 3 1 15 16 S 2 30.000000
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superrice

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
zhou2009: 金币+3 2012-04-29 08:30:17
fd_wonder: 金币+2, 非常感谢~ 2012-04-29 10:31:24
geom=connectivity
在结构说明及其修改部分之后,通过附加的输入部分(需要空行终止)
直接指定原子成键数据。该选项对每个输入的原子需要一行,顺序和原
子说明部分相同,语法为:
N1 Order1 [N2 Order2...]
其中的各个N 是和当前原子成键的原子,Order 是成键的键级。例如,这
个例子指定当前原子与原子4 和5 成键,键级分别为1.0 和2.0:
4 1.0 5 2.0
2楼2012-04-29 07:45:19
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superrice

木虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by superrice at 2012-04-29 07:45:19:
geom=connectivity
在结构说明及其修改部分之后,通过附加的输入部分(需要空行终止)
直接指定原子成键数据。该选项对每个输入的原子需要一行,顺序和原
子说明部分相同,语法为:
N1 Order1
其中的各个N  ...

选自高斯03的说明书
3楼2012-04-29 07:45:35
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070241078

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
计算时,内坐标下边1到22的参数都可以删掉的
4楼2012-04-29 09:05:59
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一起来化学

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
下面的确实可以删掉。。。。。。
大家多多交流
5楼2012-04-29 09:31:37
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fd_wonder

银虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 070241078 at 2012-04-29 09:05:59:
计算时,内坐标下边1到22的参数都可以删掉的

非常感谢~
还想问我想算两个二面角转动过程中形成的二维势能面,算到一半会报错,“The processing of the last link ended abnormally.”是啥原因呀。。我的input file如下:

%chk=D:\Drivers\Group2\Gaussview files\q2-2.chk
# opt=modredundant b3lyp/3-21g popt=maxcyc=300

q2

0 1
C                  0.00000000    0.00000000    0.00000000
H                  0.00000000    0.00000000    1.07000000
C                  1.02706726    0.00000000   -1.14748980
H                  1.19903630    1.00492118   -1.47223596
H                  1.94635986   -0.42586603   -0.80333976
H                  0.64941730   -0.57905516   -1.96417556
C                  0.29826226   -1.50185756    0.16450988
O                  0.84575512   -2.14080399   -0.77120887
N                 -0.05658664   -2.18906357    1.41460194
H                 -0.00919344   -1.54212073    2.17566624
C                  0.88448081   -3.29335924    1.65087104
H                  0.62618944   -3.79357043    2.56080200
H                  0.83377008   -3.98558808    0.83653225
H                  1.87847759   -2.90472631    1.72725707
N                  0.63025370    1.29365588    0.30022448
H                  0.27185597    1.64644200    1.16456991
C                  0.33216821    2.24614348   -0.77904028
O                  1.15135025    3.16059228   -1.05525530
H                 -0.58504003    1.24232177   -2.02761586
C                 -0.98260733    2.12490693   -1.57167322
H                 -1.05375520    2.52898262   -2.55988414
H                 -1.78861877    1.54498669   -1.17300284

D 3 1 7 8 S 36 10.000000
D 16 15 1 3 S 36 10.000000
6楼2012-04-29 10:46:22
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fd_wonder

银虫 (初入文坛)

呃,是坐标用得不对的原因吗?
7楼2012-04-29 10:50:36
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